More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0891 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_0891  transcriptional activator  100 
 
 		 167 aa  343  5e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1124  transcriptional activator RfaH  98.2 
 
 		 167 aa  336  9e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2484  transcriptional activator RfaH  50.31 
 
 		 174 aa  154  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0093  transcription antitermination protein nusG  45.62 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2265  NusG antitermination factor  45.1 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3226  transcriptional activator RfaH  38.89 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3444  transcriptional activator RfaH  37.65 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2142  transcription antitermination protein nusG  36.94 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.592011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15910  transcriptional activator RfaH  39.35 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2812  transcription antitermination protein nusG  37.42 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3755  transcriptional activator RfaH  36.42 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3907  transcriptional activator RfaH  35.29 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.519229  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4091  hypothetical protein  35.58 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.177028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3198  NusG antitermination factor  33.95 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0256  transcriptional activator RfaH  35.37 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3134  NusG antitermination factor  33.33 
 
 		 182 aa  94.4  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01331  transcriptional activator RfaH  34.15 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004133  transcriptional activator RfaH  33.54 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4048  transcriptional activator RfaH  35.33 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4239  transcriptional activator RfaH  35.37 
 
 		 162 aa  91.3  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4222  transcriptional activator RfaH  35.14 
 
 		 162 aa  91.3  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601937 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03733  transcriptional activator RfaH  35.14 
 
 		 162 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4139  transcriptional acivator RfaH  35.14 
 
 		 162 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4168  transcriptional activator RfaH  35.14 
 
 		 162 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4360  transcriptional activator RfaH  35.14 
 
 		 162 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4311  transcriptional activator RfaH  35.14 
 
 		 162 aa  90.9  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5280  transcriptional activator RfaH  35.14 
 
 		 162 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.311175  normal  0.111679 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03682  hypothetical protein  35.14 
 
 		 162 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4064  transcriptional activator RfaH  35.14 
 
 		 162 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3466  NusG antitermination factor  31.58 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2544  NusG antitermination factor  30.63 
 
 		 168 aa  89.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2672  transcriptional activator RfaH  32.08 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000489964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3953  transcriptional activator RfaH  34.69 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.038453 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3937  transcriptional activator RfaH  33.12 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4257  transcriptional activator RfaH  34.42 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4364  transcriptional activator RfaH  34.42 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.394669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4185  transcriptional activator RfaH  34.42 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0279  transcriptional activator RfaH  33.12 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4208  transcriptional activator RfaH  34.42 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4304  transcriptional activator RfaH  34.42 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1469  transcriptional acivator RfaH  30.63 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000410204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2904  transcriptional acivator RfaH  30.63 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160957  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3036  transcriptional acivator RfaH  30.63 
 
 		 168 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00758207  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2894  transcriptional acivator RfaH  30 
 
 		 168 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000245267  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1314  transcription antitermination protein nusG  30 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0397005  normal  0.368263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1381  transcription antitermination protein nusG  30 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111282  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1650  transcriptional acivator RfaH  33.33 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0204524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1374  transcription antitermination protein nusG  31.25 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000814975  hitchhiker  0.00000420235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3033  NusG antitermination factor  29.89 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201282  hitchhiker  0.00738104 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1908  transcriptional activator RfaH  32.48 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305393 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1398  NusG antitermination factor  31.43 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000128095  normal  0.158725 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194  transcriptional activator rfaH, putative  30 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1705  NusG antitermination factor  33.95 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0707648  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2844  NusG antitermination factor  31.25 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.117724  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0826  transcriptional activator RfaH  31.68 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0511  transcriptional activator RfaH  31.08 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2265  transcriptional activator rfaH, putative  30.19 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000106043  hitchhiker  0.00695369 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1394  transcriptional acivator RfaH  28.92 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133861  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  29.34 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  28.41 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  29.34 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3605  NusG antitermination factor  30.06 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  hitchhiker  0.000423635 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  29.34 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3398  NusG antitermination factor  28.66 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191132  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0546  NGN domain protein  31.41 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381555 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  28.49 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  25.29 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  28.48 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2406  transcription antitermination protein NusG  27.43 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337578  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  26.9 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0058  transcriptional activator  36.73 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  26.44 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  23.73 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  27.59 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2360  NusG antitermination factor  34.04 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00889306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  25.58 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5306  NusG antitermination factor  28.21 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955236  normal  0.0968328 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  24.14 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  24.14 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  27.59 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  27.22 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  25.14 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2062  transcription antitermination protein NusG  29.07 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0965  NusG antitermination factor  25.32 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  24.86 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  26.83 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1375  NusG antitermination factor  28 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078055  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  25.14 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  24.56 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  26.32 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  26.32 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0357  NusG antitermination factor  24.68 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5198  NusG antitermination factor  21.38 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.296838 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  25.14 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1699  NusG antitermination factor  23.64 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  26.32 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  27.53 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2803  NusG antitermination factor  24.69 
 
 		 207 aa  57.4  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  23.12 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  27.38 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>