202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_15910 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_15910  transcriptional activator RfaH  100 
 
 		 153 aa  309  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2812  transcription antitermination protein nusG  48.72 
 
 		 178 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3444  transcriptional activator RfaH  44.87 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3226  transcriptional activator RfaH  41.29 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2142  transcription antitermination protein nusG  39.62 
 
 		 182 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.592011  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1124  transcriptional activator RfaH  39.35 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2265  NusG antitermination factor  41.94 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0891  transcriptional activator  39.35 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3466  NusG antitermination factor  31.21 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0093  transcription antitermination protein nusG  39.87 
 
 		 177 aa  100  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01331  transcriptional activator RfaH  36.13 
 
 		 166 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2672  transcriptional activator RfaH  32.47 
 
 		 166 aa  92.8  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000489964  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004133  transcriptional activator RfaH  34.19 
 
 		 166 aa  91.7  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4091  hypothetical protein  34.39 
 
 		 174 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.177028 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1650  transcriptional acivator RfaH  28.99 
 
 		 179 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0204524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2265  transcriptional activator rfaH, putative  33.12 
 
 		 167 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000106043  hitchhiker  0.00695369 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4364  transcriptional activator RfaH  35.48 
 
 		 162 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.394669  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03733  transcriptional activator RfaH  34.19 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4139  transcriptional acivator RfaH  34.19 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03682  hypothetical protein  34.19 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4257  transcriptional activator RfaH  35.48 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4304  transcriptional activator RfaH  35.48 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5280  transcriptional activator RfaH  34.19 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.311175  normal  0.111679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4185  transcriptional activator RfaH  35.48 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4311  transcriptional activator RfaH  34.19 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4168  transcriptional activator RfaH  34.19 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4208  transcriptional activator RfaH  35.48 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4064  transcriptional activator RfaH  34.19 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4360  transcriptional activator RfaH  34.19 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3755  transcriptional activator RfaH  36.77 
 
 		 162 aa  87.4  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4222  transcriptional activator RfaH  34.19 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2484  transcriptional activator RfaH  34.25 
 
 		 174 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3907  transcriptional activator RfaH  35.26 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.519229  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0826  transcriptional activator RfaH  32.05 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0256  transcriptional activator RfaH  34.97 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3937  transcriptional activator RfaH  34.46 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3953  transcriptional activator RfaH  33.54 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.038453 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4048  transcriptional activator RfaH  32.9 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0279  transcriptional activator RfaH  34.46 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1394  transcriptional acivator RfaH  29.88 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133861  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4239  transcriptional activator RfaH  32.26 
 
 		 162 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2844  NusG antitermination factor  27.1 
 
 		 170 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.117724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1908  transcriptional activator RfaH  33.78 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305393 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1398  NusG antitermination factor  29.09 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000128095  normal  0.158725 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0511  transcriptional activator RfaH  28.1 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1314  transcription antitermination protein nusG  29.75 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0397005  normal  0.368263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1381  transcription antitermination protein nusG  29.75 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111282  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3033  NusG antitermination factor  27.38 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201282  hitchhiker  0.00738104 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2544  NusG antitermination factor  29.8 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194  transcriptional activator rfaH, putative  30.92 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1374  transcription antitermination protein nusG  30.26 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000814975  hitchhiker  0.00000420235 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2894  transcriptional acivator RfaH  27.5 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000245267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1469  transcriptional acivator RfaH  27.85 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000410204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2904  transcriptional acivator RfaH  27.85 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160957  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3036  transcriptional acivator RfaH  28.95 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00758207  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1705  NusG antitermination factor  29.45 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0707648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  29.37 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3134  NusG antitermination factor  30.67 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3198  NusG antitermination factor  25.85 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  28.8 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  24.6 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  26.57 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  28 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  29.17 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0887  transcription antitermination protein nusG  26.57 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.769632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0643  NusG antitermination factor  27.13 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  27.5 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  27.5 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0546  NGN domain protein  27.15 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381555 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0848  NusG antitermination factor  28.91 
 
 		 354 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000981169  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  27.59 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  25.93 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  29.46 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  28.42 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  28.69 
 
 		 185 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  24.06 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  28.42 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  22.29 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  24.79 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3605  NusG antitermination factor  28.68 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  hitchhiker  0.000423635 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  26.32 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1375  NusG antitermination factor  31.13 
 
 		 176 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  26.67 
 
 		 177 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  28.42 
 
 		 175 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0192  transcription antitermination protein NusG  28.03 
 
 		 181 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000156554  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  28.42 
 
 		 175 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  29.82 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  24.65 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  23.13 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0438  transcription termination/antitermination factor NusG  24.83 
 
 		 204 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  23.87 
 
 		 238 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  25.19 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0205  transcription antitermination protein NusG  27.27 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  25.17 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  27.37 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  23.57 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0272  transcription antitermination protein NusG  27.27 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325159  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  27.37 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  25.17 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0200  transcription antitermination protein NusG  27.27 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>