223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0887 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0887  transcription antitermination protein nusG  100 
 
 		 182 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.769632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3498  transcription antitermination protein nusG  37.65 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1699  NusG antitermination factor  37.79 
 
 		 212 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2803  NusG antitermination factor  37.04 
 
 		 207 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3605  NusG antitermination factor  27.95 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  hitchhiker  0.000423635 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1511  NusG antitermination factor  31.74 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0149  NusG antitermination factor  30.67 
 
 		 197 aa  88.6  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114969  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0965  NusG antitermination factor  30.63 
 
 		 169 aa  84.3  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1665  NusG antitermination factor  30.13 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5306  NusG antitermination factor  25.15 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955236  normal  0.0968328 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2594  transcription antitermination protein nusG  33.97 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000665583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1589  NusG antitermination factor  29.01 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262291  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0626  NusG antitermination factor  32.32 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000497813  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0546  NGN domain protein  25.9 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5198  NusG antitermination factor  27.1 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.296838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3892  NGN domain protein  28 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2360  NusG antitermination factor  28.74 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00889306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3226  transcriptional activator RfaH  27.92 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2660  NusG antitermination factor  25.81 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192124  normal  0.041125 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1705  NusG antitermination factor  30.54 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0707648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3398  NusG antitermination factor  25.81 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191132  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2812  transcription antitermination protein nusG  29.03 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2265  transcriptional activator rfaH, putative  29.45 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000106043  hitchhiker  0.00695369 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0357  NusG antitermination factor  25.19 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6306  NusG antitermination factor  26.32 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.343168 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1046  NusG antitermination factor  28.33 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3444  transcriptional activator RfaH  30.07 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  25.29 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  25.29 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  26.4 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3638  NusG antitermination factor  27.56 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2619  NusG antitermination factor  29.41 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257657  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1953  NusG antitermination factor  26.06 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00519694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4086  NusG antitermination factor  29.7 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.217756  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1650  transcriptional acivator RfaH  28.81 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0204524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3036  transcriptional acivator RfaH  28.74 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00758207  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2894  transcriptional acivator RfaH  28.99 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000245267  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1398  NusG antitermination factor  27.43 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000128095  normal  0.158725 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15910  transcriptional activator RfaH  26.57 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2265  NusG antitermination factor  27.33 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  26.09 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  28.98 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2544  NusG antitermination factor  27.54 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2484  transcriptional activator RfaH  29.19 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1469  transcriptional acivator RfaH  27.88 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000410204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  28.57 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2904  transcriptional acivator RfaH  27.88 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  26.47 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2844  NusG antitermination factor  29.31 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.117724  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4226  NusG antitermination factor  25.5 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.841034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0832  transcription antitermination protein nusG  29.94 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  24.26 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  24.42 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01331  transcriptional activator RfaH  23.17 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  23.84 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2672  transcriptional activator RfaH  23.75 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000489964  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  26.16 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1374  transcription antitermination protein nusG  28.12 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000814975  hitchhiker  0.00000420235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  30.23 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0438  transcription termination/antitermination factor NusG  27.81 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  23.67 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0826  transcriptional activator RfaH  21.74 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  27.27 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  28.07 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  24.55 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0511  transcriptional activator RfaH  24.84 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1394  transcriptional acivator RfaH  27.17 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133861  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  25.84 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  27.27 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1314  transcription antitermination protein nusG  26.83 
 
 		 166 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0397005  normal  0.368263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1381  transcription antitermination protein nusG  26.83 
 
 		 166 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111282  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  23.12 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3033  NusG antitermination factor  27.75 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201282  hitchhiker  0.00738104 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  25.29 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0283  NusG antitermination factor  26.06 
 
 		 191 aa  51.2  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000819878  hitchhiker  0.00383281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  24.71 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  25.29 
 
 		 183 aa  51.2  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  22.67 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194  transcriptional activator rfaH, putative  27.54 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  27.01 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  25.29 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1631  NusG antitermination factor  25.29 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  28.74 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  24.42 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  28 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  25.86 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  25.29 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0396  transcription termination/antitermination factor NusG  25.41 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000310476  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  26.04 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  22.99 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  26.01 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  24.12 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2142  transcription antitermination protein nusG  22.97 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.592011  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  28 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  25.15 
 
 		 175 aa  48.5  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  25.29 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  24.71 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0228  transcription antitermination protein nusG  25.57 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00207828  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0176  transcription antitermination protein NusG  27.27 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  25.58 
 
 		 175 aa  48.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>