41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3638 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3638  NusG antitermination factor  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1511  NusG antitermination factor  29.45 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1589  NusG antitermination factor  28.07 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262291  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0965  NusG antitermination factor  28.92 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3605  NusG antitermination factor  26.01 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  hitchhiker  0.000423635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5306  NusG antitermination factor  27.63 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955236  normal  0.0968328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1699  NusG antitermination factor  27.95 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2803  NusG antitermination factor  27.11 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3498  transcription antitermination protein nusG  30.54 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3892  NGN domain protein  24.03 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0149  NusG antitermination factor  24.71 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114969  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0626  NusG antitermination factor  25.45 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000497813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3398  NusG antitermination factor  29.01 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191132  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1665  NusG antitermination factor  22.84 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0887  transcription antitermination protein nusG  27.56 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.769632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5198  NusG antitermination factor  26.42 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.296838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0546  NGN domain protein  26.49 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381555 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2594  transcription antitermination protein nusG  23.42 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000665583  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2660  NusG antitermination factor  41.54 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192124  normal  0.041125 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2844  NusG antitermination factor  27.75 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.117724  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0357  NusG antitermination factor  23.61 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3134  NusG antitermination factor  27.01 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2360  NusG antitermination factor  27.45 
 
 		 185 aa  51.2  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00889306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6306  NusG antitermination factor  25 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.343168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2672  transcriptional activator RfaH  25.32 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000489964  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2544  NusG antitermination factor  26.06 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1705  NusG antitermination factor  30.18 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0707648  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3198  NusG antitermination factor  24.56 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2894  transcriptional acivator RfaH  23.81 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000245267  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3036  transcriptional acivator RfaH  24.4 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00758207  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2904  transcriptional acivator RfaH  24.4 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1469  transcriptional acivator RfaH  24.4 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000410204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1374  transcription antitermination protein nusG  24.55 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000814975  hitchhiker  0.00000420235 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0891  transcriptional activator  22.35 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194  transcriptional activator rfaH, putative  26.06 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1314  transcription antitermination protein nusG  23.81 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0397005  normal  0.368263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1381  transcription antitermination protein nusG  23.81 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111282  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1124  transcriptional activator RfaH  22.35 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1650  transcriptional acivator RfaH  21.14 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0204524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2398  NusG antitermination factor  32.81 
 
 		 196 aa  41.2  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0237  NusG antitermination factor  29.84 
 
 		 192 aa  40.8  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>