More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2594 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2594  transcription antitermination protein nusG  100 
 
 		 180 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000665583  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1665  NusG antitermination factor  76.25 
 
 		 170 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1589  NusG antitermination factor  71.76 
 
 		 184 aa  254  4e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262291  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0149  NusG antitermination factor  71.95 
 
 		 197 aa  254  5e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114969  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0626  NusG antitermination factor  72.35 
 
 		 196 aa  250  6e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000497813  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0965  NusG antitermination factor  61.82 
 
 		 169 aa  208  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1511  NusG antitermination factor  61.76 
 
 		 172 aa  206  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3892  NGN domain protein  35.76 
 
 		 176 aa  108  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5198  NusG antitermination factor  34.29 
 
 		 170 aa  101  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.296838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0546  NGN domain protein  33.33 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2360  NusG antitermination factor  34.51 
 
 		 185 aa  92.8  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00889306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1699  NusG antitermination factor  33.33 
 
 		 212 aa  86.3  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6306  NusG antitermination factor  33.59 
 
 		 160 aa  86.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.343168 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2803  NusG antitermination factor  32.26 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0887  transcription antitermination protein nusG  33.97 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.769632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3605  NusG antitermination factor  28.76 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  hitchhiker  0.000423635 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0357  NusG antitermination factor  28.67 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3498  transcription antitermination protein nusG  33.53 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  33.33 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2660  NusG antitermination factor  26.42 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192124  normal  0.041125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2812  transcription antitermination protein nusG  27.48 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3398  NusG antitermination factor  20.99 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191132  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5306  NusG antitermination factor  27.22 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955236  normal  0.0968328 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3036  transcriptional acivator RfaH  27.22 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00758207  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2844  NusG antitermination factor  26.97 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.117724  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2894  transcriptional acivator RfaH  27.67 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000245267  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2904  transcriptional acivator RfaH  27.95 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1469  transcriptional acivator RfaH  27.95 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000410204  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194  transcriptional activator rfaH, putative  27.22 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  29.94 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2265  NusG antitermination factor  25.97 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3451  NusG antitermination factor  32.24 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0281776  normal  0.0124295 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3466  NusG antitermination factor  26.52 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  29.94 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01331  transcriptional activator RfaH  27.1 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  30.38 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2544  NusG antitermination factor  29.19 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  33.33 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0643  NusG antitermination factor  30.38 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  33.33 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  30.71 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  30.71 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  30.99 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1314  transcription antitermination protein nusG  25.83 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0397005  normal  0.368263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1381  transcription antitermination protein nusG  25.83 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111282  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1374  transcription antitermination protein nusG  24.84 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000814975  hitchhiker  0.00000420235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  34.04 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  34.04 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0826  transcriptional activator RfaH  27.04 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  33.1 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  32.62 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  30.5 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  30.5 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  30.5 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  30.5 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1103  NusG antitermination factor  28.14 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00324857  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  30.5 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  30.5 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1650  transcriptional acivator RfaH  26.14 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0204524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  31.21 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0511  transcriptional activator RfaH  26.28 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  29.2 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3638  NusG antitermination factor  23.42 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2265  transcriptional activator rfaH, putative  25.3 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000106043  hitchhiker  0.00695369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  30.07 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  33.58 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004133  transcriptional activator RfaH  23.57 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1867  transcription antitermination protein  31.72 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420515  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0322  transcription termination/antitermination factor NusG  31.72 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00302903  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0593  NusG antitermination factor  28.57 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0256  transcriptional activator RfaH  24.68 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2239  NusG antitermination factor  25.56 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000688878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  29.79 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4014  transcription antitermination protein NusG  28.89 
 
 		 217 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0690629  hitchhiker  0.000000338783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06110  transcription termination/antitermination factor NusG  33.64 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2142  transcription antitermination protein nusG  24.4 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.592011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  31.21 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  29.61 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  31.47 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0093  transcription antitermination protein nusG  26.39 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00690  transcription termination/antitermination factor NusG  27.33 
 
 		 183 aa  52  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000164845  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1398  NusG antitermination factor  25 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000128095  normal  0.158725 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0311  NusG antitermination factor  29.37 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04536  transcription antitermination protein NusG  29.8 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  28.66 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  31.76 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  28.99 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1041  NusG antitermination factor  30.19 
 
 		 209 aa  51.6  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0043552  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2041  NusG antitermination factor  28.97 
 
 		 176 aa  52  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1705  NusG antitermination factor  29.41 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0707648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4777  transcription termination/antitermination factor NusG  29.37 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  30.5 
 
 		 177 aa  51.2  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0744  transcription antitermination protein NusG  30 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000594191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2684  NusG antitermination factor  27.4 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000736005  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0228  transcription antitermination protein nusG  28.37 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00207828  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  28.97 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1967  NusG antitermination factor  26.85 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.688216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0352  NusG antitermination factor  29.08 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000459133  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0891  transcriptional activator  23.29 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  30.28 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>