More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2803 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2803  NusG antitermination factor  100 
 
 		 207 aa  423  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1699  NusG antitermination factor  71.86 
 
 		 212 aa  304  7e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0887  transcription antitermination protein nusG  37.04 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.769632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3605  NusG antitermination factor  33.75 
 
 		 174 aa  91.7  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  hitchhiker  0.000423635 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0965  NusG antitermination factor  31.93 
 
 		 169 aa  90.9  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1589  NusG antitermination factor  31.18 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5306  NusG antitermination factor  34.15 
 
 		 174 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955236  normal  0.0968328 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2594  transcription antitermination protein nusG  32.26 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000665583  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1665  NusG antitermination factor  30.3 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5198  NusG antitermination factor  34.62 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.296838 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0149  NusG antitermination factor  29.68 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114969  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1511  NusG antitermination factor  29.63 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0626  NusG antitermination factor  32.08 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000497813  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1705  NusG antitermination factor  29.01 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0707648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3498  transcription antitermination protein nusG  30.56 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2672  transcriptional activator RfaH  30.38 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000489964  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  24.26 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3892  NGN domain protein  28.99 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0546  NGN domain protein  28.3 
 
 		 168 aa  67.8  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381555 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  25.15 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  28.04 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3638  NusG antitermination factor  27.11 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004133  transcriptional activator RfaH  27.98 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2360  NusG antitermination factor  27.69 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00889306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  25.29 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1953  NusG antitermination factor  22.78 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00519694  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2844  NusG antitermination factor  28.66 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.117724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01331  transcriptional activator RfaH  29.17 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  26.59 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  26.29 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1103  NusG antitermination factor  24.28 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00324857  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  23.3 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  25 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  24.86 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2265  NusG antitermination factor  26.79 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  24.28 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0826  transcriptional activator RfaH  26.99 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2484  transcriptional activator RfaH  28.4 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3454  NusG antitermination factor  28.65 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000805693  normal  0.0356218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  25.57 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  27.01 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  22.73 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  23.7 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  26.16 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  26.29 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3398  NusG antitermination factor  25.77 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191132  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0191  NusG antitermination factor  24.28 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382089  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1967  NusG antitermination factor  23.7 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.688216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2904  transcriptional acivator RfaH  28.57 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160957  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2684  NusG antitermination factor  24.86 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000736005  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0891  transcriptional activator  24.69 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1469  transcriptional acivator RfaH  28.57 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000410204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1046  NusG antitermination factor  26.67 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0396  transcription termination/antitermination factor NusG  27.07 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000310476  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3036  transcriptional acivator RfaH  28.57 
 
 		 168 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00758207  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  23.26 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  25.97 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1314  transcription antitermination protein nusG  28.57 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0397005  normal  0.368263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1381  transcription antitermination protein nusG  28.57 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111282  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  24.14 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1374  transcription antitermination protein nusG  28.57 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000814975  hitchhiker  0.00000420235 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0228  transcription antitermination protein nusG  22.54 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00207828  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  28.57 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  23.12 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  25.86 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  25.34 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  25.34 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  27.37 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0314  NusG antitermination factor  22.54 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000044126  decreased coverage  0.000127563 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  27.45 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0283  NusG antitermination factor  23.12 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000819878  hitchhiker  0.00383281 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0352  NusG antitermination factor  22.41 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000459133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  22.42 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  24.14 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  27.17 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  24.14 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1920  NusG antitermination factor  24.85 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  hitchhiker  0.00427943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2364  NusG antitermination factor  25.99 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0318836  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  28.32 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2142  transcription antitermination protein nusG  27.08 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.592011  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  23.84 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  24.71 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2894  transcriptional acivator RfaH  27.86 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000245267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2276  NusG antitermination factor  25.99 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194  transcriptional activator rfaH, putative  28.57 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1587  transcription antitermination protein nusG  24.86 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  25.29 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  25 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  25 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  25.29 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  25.29 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  22.29 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1867  transcription antitermination protein  26.32 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420515  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  25.29 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0641  NusG antitermination factor  25.74 
 
 		 356 aa  54.7  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000301277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  24.29 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2544  NusG antitermination factor  27.14 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  27.17 
 
 		 176 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  23.7 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6306  NusG antitermination factor  25.64 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.343168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>