More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0641 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0641  NusG antitermination factor  100 
 
 		 356 aa  709    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000301277  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0482  NusG antitermination factor  54.93 
 
 		 353 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000917013  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0467  NusG antitermination factor  55.21 
 
 		 353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000572665  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0848  NusG antitermination factor  56.9 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000981169  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0360  NusG antitermination factor  41.01 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000977619  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  49.6 
 
 		 176 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  44.06 
 
 		 174 aa  123  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  41.96 
 
 		 175 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  43.8 
 
 		 181 aa  119  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  41.22 
 
 		 175 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  38.41 
 
 		 172 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  42.74 
 
 		 175 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  37.76 
 
 		 175 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  39.86 
 
 		 177 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2077  NusG antitermination factor  37.66 
 
 		 179 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  46.09 
 
 		 182 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  42.86 
 
 		 201 aa  112  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  45.31 
 
 		 182 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1631  NusG antitermination factor  36.77 
 
 		 190 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  37.5 
 
 		 243 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  36.36 
 
 		 184 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  41.1 
 
 		 181 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  45.31 
 
 		 182 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0832  transcription antitermination protein nusG  42.07 
 
 		 178 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  39.52 
 
 		 175 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  44.09 
 
 		 181 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  39.86 
 
 		 174 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  37.76 
 
 		 180 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  37.32 
 
 		 183 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2786  NusG antitermination factor  35.06 
 
 		 180 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000144907  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  40.46 
 
 		 203 aa  109  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  37.5 
 
 		 188 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2991  transcription antitermination protein nusG  38.03 
 
 		 184 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  38.22 
 
 		 176 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  37.41 
 
 		 178 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  37.09 
 
 		 179 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  39.58 
 
 		 194 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0438  transcription termination/antitermination factor NusG  32.84 
 
 		 204 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  35.47 
 
 		 194 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  38.81 
 
 		 179 aa  106  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  42.52 
 
 		 176 aa  106  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  35.47 
 
 		 194 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  37.04 
 
 		 185 aa  106  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0146  NusG antitermination factor  43.31 
 
 		 180 aa  106  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000173451  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0172  NusG antitermination factor  44.09 
 
 		 183 aa  106  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325102  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4702  NusG antitermination factor  43.31 
 
 		 183 aa  106  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000069225  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  39.58 
 
 		 187 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  38.89 
 
 		 194 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  40.46 
 
 		 177 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  35.43 
 
 		 176 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0643  NusG antitermination factor  37.89 
 
 		 190 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  39.57 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  41.27 
 
 		 177 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  42.65 
 
 		 238 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  38.06 
 
 		 177 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0188  NusG antitermination factor  41.27 
 
 		 183 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000173496  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0184  NusG antitermination factor  41.27 
 
 		 183 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4068  NusG antitermination factor  41.27 
 
 		 183 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000120393  hitchhiker  0.00918489 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0136  NusG antitermination factor  41.73 
 
 		 183 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4470  NusG antitermination factor  41.27 
 
 		 183 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4329  NusG antitermination factor  43.31 
 
 		 183 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000065431  hitchhiker  0.00000000191931 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3771  NusG antitermination factor  41.27 
 
 		 183 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  40.41 
 
 		 182 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  40.41 
 
 		 182 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0158  transcription termination/antitermination factor NusG  42.52 
 
 		 183 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000171251  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  40 
 
 		 266 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  42.52 
 
 		 181 aa  103  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  42.52 
 
 		 181 aa  103  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  41.98 
 
 		 177 aa  103  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  42.52 
 
 		 181 aa  103  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0219  transcription antitermination protein NusG  40.48 
 
 		 183 aa  103  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  42.52 
 
 		 181 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4477  transcription antitermination protein NusG  42.52 
 
 		 181 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00122338  hitchhiker  0.00131185 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  42.52 
 
 		 181 aa  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  42.52 
 
 		 181 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  42.52 
 
 		 181 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  42.52 
 
 		 181 aa  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  42.52 
 
 		 181 aa  103  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  42.52 
 
 		 178 aa  103  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  42.52 
 
 		 181 aa  103  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  42.52 
 
 		 181 aa  103  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375303  normal  0.085047 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  42.52 
 
 		 181 aa  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0187  transcription antitermination protein nusG  40.48 
 
 		 183 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000177465  hitchhiker  0.00840518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0182  transcription antitermination protein nusG  40.48 
 
 		 183 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000371558  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4390  transcription antitermination protein NusG  42.52 
 
 		 181 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826486  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  42.52 
 
 		 181 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  0.000000000000240769 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  42.52 
 
 		 181 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  42.52 
 
 		 181 aa  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 176 aa  103  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  34.12 
 
 		 177 aa  102  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  29.68 
 
 		 199 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  42.52 
 
 		 177 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  42.52 
 
 		 177 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  42.52 
 
 		 177 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0272  transcription antitermination protein NusG  41.73 
 
 		 181 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325159  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  39.04 
 
 		 182 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1021  transcription antitermination protein NusG  36.02 
 
 		 213 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  35.58 
 
 		 178 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  41.73 
 
 		 181 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  41.73 
 
 		 181 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>