More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2239 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2239  NusG antitermination factor  100 
 
 
179 aa  350  7e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000688878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4226  NusG antitermination factor  37.95 
 
 
164 aa  104  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.841034  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1362  NusG antitermination factor  33.15 
 
 
185 aa  97.8  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0821693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0204  NusG antitermination factor  30.86 
 
 
188 aa  95.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  29.7 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0849  NusG antitermination factor  27.81 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  29.24 
 
 
189 aa  89  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  30.12 
 
 
180 aa  89  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  32.53 
 
 
194 aa  88.6  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  31.52 
 
 
187 aa  89  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  30.73 
 
 
179 aa  87.8  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  31.07 
 
 
178 aa  87  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  31.93 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  29.14 
 
 
176 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  33.33 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  29.94 
 
 
177 aa  85.5  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  33.33 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  28.74 
 
 
176 aa  85.1  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  29.14 
 
 
176 aa  84.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  30.12 
 
 
176 aa  84.3  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2445  NusG antitermination factor  30.95 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.012878  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  29.14 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  30.72 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  30.86 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  28.48 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  28.57 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  28.33 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0560  transcription antitermination protein nusG  29.52 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  31.4 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3451  NusG antitermination factor  30.73 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0281776  normal  0.0124295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0348  NusG antitermination factor  30.72 
 
 
177 aa  82  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789152  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2547  NusG antitermination factor  30.72 
 
 
178 aa  82  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1704  transcription antitermination protein nusG  30.72 
 
 
177 aa  82  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  30.29 
 
 
177 aa  82  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0334  NusG antitermination factor  30.72 
 
 
177 aa  82  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0344546  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  30.29 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  31.33 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  31.93 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  27.71 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0742  NusG antitermination factor  27.38 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0172264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  32.53 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  32.53 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  28.32 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0227  transcription antitermination protein nusG  28.57 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.355469  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  30 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  27.84 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0259  NusG antitermination factor  28.92 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  30.64 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  29.41 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  27.59 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  28.41 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  28.41 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  28.32 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  30.18 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  27.43 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  30.72 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  30.3 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00050  putative transcription antitermination protein  29.61 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12290  transcription antiterminator  29.7 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369392  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  27.75 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  30.3 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0158  transcription termination/antitermination factor NusG  30.11 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000171251  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  28.41 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  27.17 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1492  NusG antitermination factor  28.25 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.509367  normal  0.372591 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4470  NusG antitermination factor  30.64 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0188  NusG antitermination factor  30.64 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000173496  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0444  transcription antitermination protein NusG  30.29 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00370515  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4068  NusG antitermination factor  30.64 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000120393  hitchhiker  0.00918489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0184  NusG antitermination factor  30.64 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  30.72 
 
 
174 aa  79  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  28.57 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  30.3 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  31.64 
 
 
175 aa  79  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  27.43 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  28 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4702  NusG antitermination factor  29.41 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000069225  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  27.43 
 
 
177 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0219  transcription antitermination protein NusG  30.11 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3771  NusG antitermination factor  30.11 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0187  transcription antitermination protein nusG  30.11 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000177465  hitchhiker  0.00840518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0182  transcription antitermination protein nusG  30.11 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000371558  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0187  transcription antitermination protein nusG  30.11 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000254051  normal  0.0190585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  28.74 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  28.14 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0172  NusG antitermination factor  28.9 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325102  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  29.71 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  29.71 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  30.68 
 
 
174 aa  77.4  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1631  NusG antitermination factor  30.36 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  31.33 
 
 
196 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  28 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  30.72 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  28.25 
 
 
177 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  28.9 
 
 
177 aa  77.4  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0136  NusG antitermination factor  29.48 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  28 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1668  transcription antitermination protein NusG  27.91 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0130356  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0176  transcription antitermination protein NusG  28.9 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  25.3 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>