More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2398 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2398  NusG antitermination factor  100 
 
 		 196 aa  391  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134344  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  30.16 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  29.63 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  29.63 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  27.27 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  29.5 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1492  NusG antitermination factor  27.36 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.509367  normal  0.372591 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  27.42 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  25.27 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  29.35 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  26.29 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4091  hypothetical protein  27.46 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.177028 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  26.49 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  26.29 
 
 		 177 aa  62  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  28.06 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2062  transcription antitermination protein NusG  25 
 
 		 179 aa  62  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  27.18 
 
 		 177 aa  62  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  28.04 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2265  NusG antitermination factor  24.74 
 
 		 175 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  26.42 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  23.96 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  26.42 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  26.42 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  27.23 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  25.54 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  25.14 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  26.56 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  26.32 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  28.57 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0188  NusG antitermination factor  27.69 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000173496  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4470  NusG antitermination factor  27.69 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0184  NusG antitermination factor  27.69 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4068  NusG antitermination factor  27.69 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000120393  hitchhiker  0.00918489 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  27.81 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  27.6 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0193  transcription antitermination protein NusG  26 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000930263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0146  NusG antitermination factor  25.64 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000173451  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3771  NusG antitermination factor  25.63 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0219  transcription antitermination protein NusG  25.63 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  25.79 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0187  transcription antitermination protein nusG  25.63 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000177465  hitchhiker  0.00840518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0182  transcription antitermination protein nusG  25.63 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000371558  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17300  transcription termination/antitermination factor NusG  26.32 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0201  transcription antitermination protein NusG  27.18 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538288  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  26.9 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3226  transcriptional activator RfaH  26.4 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0164  transcription antitermination protein NusG  22.51 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  28.11 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0187  transcription antitermination protein nusG  25.63 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000254051  normal  0.0190585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  24.59 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1705  NusG antitermination factor  29.32 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0707648  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  27.08 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0832  transcription antitermination protein nusG  25.52 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  26.7 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0263  transcription antitermination protein NusG  22.47 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000027375  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2426  transcription antitermination protein NusG  23.23 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000129049  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  24.59 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  27.55 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  24.86 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  26.15 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2660  NusG antitermination factor  30.84 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192124  normal  0.041125 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2276  NusG antitermination factor  27.84 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  26.8 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2364  NusG antitermination factor  27.84 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0318836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  25.54 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  26.29 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  25.91 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1587  transcription antitermination protein nusG  27.84 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  23.81 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0957  transcription antitermination protein NusG  21.47 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0172  NusG antitermination factor  25.13 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325102  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  28.35 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  27.23 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0438  transcription termination/antitermination factor NusG  24.06 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  24.87 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  24.04 
 
 		 271 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  26.34 
 
 		 276 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  25.77 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  27.04 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  24.32 
 
 		 280 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  25.89 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  27.36 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  26.78 
 
 		 301 aa  53.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  23.5 
 
 		 270 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  25.64 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  26.09 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2041  NusG antitermination factor  25 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  25.65 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2803  NusG antitermination factor  25 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  23.5 
 
 		 270 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3466  NusG antitermination factor  22.04 
 
 		 169 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  25.91 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3444  transcriptional activator RfaH  23.6 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  24.87 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1549  transcription antitermination protein nusG  25.77 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  27.84 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  26.29 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  25.13 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  26.09 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  26.09 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>