More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2426 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2426  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 		 185 aa  376  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000129049  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0396  transcription termination/antitermination factor NusG  45.95 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000310476  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  43.96 
 
 		 178 aa  149  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  45.11 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  44.26 
 
 		 177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  41.49 
 
 		 306 aa  145  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  46.24 
 
 		 175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  43.41 
 
 		 176 aa  143  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  44.63 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  41.53 
 
 		 177 aa  142  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  42.7 
 
 		 180 aa  142  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  41.85 
 
 		 176 aa  140  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  42.93 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  42.62 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  43.24 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  42.08 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0193  transcription antitermination protein NusG  41.99 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000930263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  41.53 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2991  transcription antitermination protein nusG  42.7 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  41.53 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  40.98 
 
 		 176 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  42.08 
 
 		 176 aa  138  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0560  transcription antitermination protein nusG  42.31 
 
 		 177 aa  137  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  43.65 
 
 		 184 aa  137  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  40.11 
 
 		 178 aa  137  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  40.44 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1631  NusG antitermination factor  44.51 
 
 		 190 aa  136  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  40.44 
 
 		 177 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  41.34 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  41.53 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  44.26 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  44.26 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  40.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  40.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  40.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  40.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  40.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  44.15 
 
 		 181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  41.08 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  40.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  40.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  40.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  40.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  40.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  40.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  41.08 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  40.76 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  40.76 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  43.72 
 
 		 175 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  40.76 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  41.08 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  40.76 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  41.18 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  41.08 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4288  NusG antitermination factor  42.16 
 
 		 177 aa  135  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000127222  hitchhiker  0.00000238714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  40.98 
 
 		 177 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  40.98 
 
 		 177 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  40.54 
 
 		 177 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  39.68 
 
 		 185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  38.12 
 
 		 177 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  42.62 
 
 		 175 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  43.02 
 
 		 188 aa  134  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  41.08 
 
 		 177 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  40.76 
 
 		 178 aa  134  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  43.17 
 
 		 175 aa  134  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  37.57 
 
 		 177 aa  134  8e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4702  NusG antitermination factor  39.78 
 
 		 183 aa  134  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000069225  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  40.88 
 
 		 185 aa  134  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  40.98 
 
 		 177 aa  134  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3451  NusG antitermination factor  39.78 
 
 		 183 aa  134  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0281776  normal  0.0124295 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  40.66 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  40.66 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  40.98 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  41.34 
 
 		 199 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  40.66 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  39.78 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  41.53 
 
 		 177 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  38.12 
 
 		 177 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  39.46 
 
 		 177 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  39.46 
 
 		 177 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  38.59 
 
 		 181 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  44.26 
 
 		 175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  43.17 
 
 		 175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0742  NusG antitermination factor  41.76 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0172264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  37.57 
 
 		 266 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  39.78 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2077  NusG antitermination factor  41.81 
 
 		 179 aa  132  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2786  NusG antitermination factor  41.81 
 
 		 180 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000144907  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  40.44 
 
 		 177 aa  131  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  39.23 
 
 		 201 aa  131  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0158  transcription termination/antitermination factor NusG  38.12 
 
 		 183 aa  131  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000171251  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  40.22 
 
 		 177 aa  131  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  40.78 
 
 		 198 aa  131  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1103  NusG antitermination factor  42.86 
 
 		 186 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00324857  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  40.44 
 
 		 194 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  41.9 
 
 		 192 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  39.67 
 
 		 176 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  40.22 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  39.67 
 
 		 176 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3771  NusG antitermination factor  38.67 
 
 		 183 aa  130  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>