More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0957 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0957  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
179 aa  362  2e-99  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0164  transcription antitermination protein NusG  91.06 
 
 
181 aa  335  1.9999999999999998e-91  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0019  transcription antitermination protein NusG, putative  46.96 
 
 
196 aa  154  8e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000223141  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0219  transcription antitermination protein NusG  37.14 
 
 
183 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3771  NusG antitermination factor  37.14 
 
 
183 aa  138  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0187  transcription antitermination protein nusG  37.14 
 
 
183 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000177465  hitchhiker  0.00840518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0182  transcription antitermination protein nusG  37.14 
 
 
183 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000371558  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4068  NusG antitermination factor  37.14 
 
 
183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000120393  hitchhiker  0.00918489 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0188  NusG antitermination factor  37.14 
 
 
183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000173496  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0172  NusG antitermination factor  38.86 
 
 
183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325102  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4470  NusG antitermination factor  37.14 
 
 
183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0184  NusG antitermination factor  37.14 
 
 
183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410017  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0187  transcription antitermination protein nusG  37.14 
 
 
183 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000254051  normal  0.0190585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0146  NusG antitermination factor  37.14 
 
 
180 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000173451  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0201  transcription antitermination protein NusG  34.86 
 
 
183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538288  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0158  transcription termination/antitermination factor NusG  35.23 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000171251  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0136  NusG antitermination factor  35.43 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  32.77 
 
 
177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  34.46 
 
 
182 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  34.86 
 
 
185 aa  127  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  37.29 
 
 
177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  37.29 
 
 
177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  37.29 
 
 
177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  35.59 
 
 
176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4329  NusG antitermination factor  36 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000065431  hitchhiker  0.00000000191931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  33.9 
 
 
177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4702  NusG antitermination factor  35.43 
 
 
183 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000069225  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  32.77 
 
 
177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  35.03 
 
 
176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  32.77 
 
 
177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  31.64 
 
 
177 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  31.64 
 
 
177 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  32.2 
 
 
177 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  32.2 
 
 
177 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  32.2 
 
 
177 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4288  NusG antitermination factor  32.77 
 
 
177 aa  124  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000127222  hitchhiker  0.00000238714 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  35.03 
 
 
177 aa  124  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  33.33 
 
 
182 aa  124  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  32.2 
 
 
177 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0205  transcription antitermination protein NusG  35.43 
 
 
181 aa  124  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  33.33 
 
 
177 aa  124  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0200  transcription antitermination protein NusG  35.43 
 
 
181 aa  124  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  35.59 
 
 
177 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  34.86 
 
 
181 aa  123  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  34.86 
 
 
181 aa  123  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  36.16 
 
 
176 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  33.52 
 
 
177 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  33.33 
 
 
176 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  34.86 
 
 
181 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4477  transcription antitermination protein NusG  34.66 
 
 
181 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00122338  hitchhiker  0.00131185 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  32.77 
 
 
177 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  36.16 
 
 
176 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  34.66 
 
 
181 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0497  transcription termination/antitermination factor NusG  34.88 
 
 
181 aa  122  3e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  34.86 
 
 
181 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  34.66 
 
 
181 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4390  transcription antitermination protein NusG  34.66 
 
 
181 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  36 
 
 
185 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  34.66 
 
 
181 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  0.000000000000240769 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  34.86 
 
 
181 aa  122  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375303  normal  0.085047 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  32.77 
 
 
182 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  35.59 
 
 
176 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  36.16 
 
 
176 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  34.09 
 
 
181 aa  121  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  34.09 
 
 
181 aa  121  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  34.09 
 
 
181 aa  121  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  34.09 
 
 
181 aa  121  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  34.09 
 
 
181 aa  121  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  34.09 
 
 
181 aa  121  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  34.09 
 
 
181 aa  121  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  35.59 
 
 
176 aa  121  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  34.09 
 
 
181 aa  121  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  34.09 
 
 
181 aa  121  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0272  transcription antitermination protein NusG  34.86 
 
 
181 aa  121  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325159  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  35.03 
 
 
176 aa  120  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  33.9 
 
 
176 aa  120  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  35.59 
 
 
176 aa  120  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  33.33 
 
 
177 aa  120  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0192  transcription antitermination protein NusG  34.09 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000156554  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0193  transcription antitermination protein NusG  34.09 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000930263  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  37.85 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  33.9 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  34.29 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  34.66 
 
 
177 aa  119  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  33.33 
 
 
176 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  33.33 
 
 
177 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00690  transcription termination/antitermination factor NusG  33.52 
 
 
183 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000164845  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  33.33 
 
 
177 aa  118  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  33.33 
 
 
176 aa  118  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  33.52 
 
 
177 aa  117  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0593  NusG antitermination factor  34.3 
 
 
190 aa  118  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  33.33 
 
 
176 aa  117  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  33.33 
 
 
177 aa  117  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  33.33 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  32.77 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  32.77 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  32.77 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  33.33 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4777  transcription termination/antitermination factor NusG  33.14 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0832  transcription antitermination protein nusG  37.5 
 
 
178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>