59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2619 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2619  NusG antitermination factor  100 
 
 		 196 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257657  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4086  NusG antitermination factor  96.53 
 
 		 173 aa  339  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.217756  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8189  NusG antitermination factor  96.58 
 
 		 118 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8191  Transposase and inactivated derivatives-like protein  87.72 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451831  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1705  NusG antitermination factor  30.59 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0707648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0887  transcription antitermination protein nusG  29.41 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.769632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  29.29 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  28.97 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  28.87 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  29.17 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  29.22 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  30.7 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4091  hypothetical protein  26.62 
 
 		 174 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.177028 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0891  transcriptional activator  29.33 
 
 		 167 aa  48.9  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  25.36 
 
 		 243 aa  48.5  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0256  transcriptional activator RfaH  31.72 
 
 		 162 aa  48.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  26.76 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0643  NusG antitermination factor  28.03 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  23.87 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  29.6 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1665  NusG antitermination factor  24.55 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1124  transcriptional activator RfaH  27.61 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2398  NusG antitermination factor  26.09 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134344  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  29.6 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  30.51 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  27.61 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  29.86 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  29.86 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2364  NusG antitermination factor  25.83 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0318836  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2276  NusG antitermination factor  25.83 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3605  NusG antitermination factor  25 
 
 		 174 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  hitchhiker  0.000423635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1699  NusG antitermination factor  23.78 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  26.92 
 
 		 182 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  26.92 
 
 		 182 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1587  transcription antitermination protein nusG  25.17 
 
 		 179 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  25.17 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  26.96 
 
 		 175 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194  transcriptional activator rfaH, putative  24.84 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  24.82 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0093  transcription antitermination protein nusG  32.24 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1374  transcription antitermination protein nusG  27.05 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000814975  hitchhiker  0.00000420235 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3953  transcriptional activator RfaH  28.97 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.038453 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  25.71 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  28.45 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2803  NusG antitermination factor  23.98 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2544  NusG antitermination factor  26.05 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  26.89 
 
 		 172 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  23.65 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15910  transcriptional activator RfaH  25.68 
 
 		 153 aa  42.4  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  22.75 
 
 		 173 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1314  transcription antitermination protein nusG  25.16 
 
 		 166 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0397005  normal  0.368263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1381  transcription antitermination protein nusG  25.16 
 
 		 166 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111282  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0641  NusG antitermination factor  27.12 
 
 		 356 aa  41.6  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000301277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4364  transcriptional activator RfaH  29.29 
 
 		 162 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.394669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1375  NusG antitermination factor  25.84 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078055  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2265  NusG antitermination factor  26.11 
 
 		 175 aa  41.6  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3134  NusG antitermination factor  27.39 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3466  NusG antitermination factor  22.62 
 
 		 169 aa  41.2  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  27.27 
 
 		 174 aa  41.2  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>