29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8189 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8189  NusG antitermination factor  100 
 
 		 118 aa  235  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4086  NusG antitermination factor  97.44 
 
 		 173 aa  231  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.217756  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2619  NusG antitermination factor  96.58 
 
 		 196 aa  231  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  30.09 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1705  NusG antitermination factor  31.67 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0707648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  27.12 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  29.03 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  29.73 
 
 		 181 aa  47.8  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4091  hypothetical protein  29.46 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.177028 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  26.09 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  29.57 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  29.57 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  29.57 
 
 		 177 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  25.4 
 
 		 243 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  29.91 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0256  transcriptional activator RfaH  31.86 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1124  transcriptional activator RfaH  30.17 
 
 		 167 aa  42.7  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  25.81 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  27.78 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0891  transcriptional activator  30.17 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  29.91 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2803  NusG antitermination factor  27.93 
 
 		 207 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0887  transcription antitermination protein nusG  30.09 
 
 		 182 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.769632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  28.83 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  27.59 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0641  NusG antitermination factor  27.97 
 
 		 356 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000301277  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0093  transcription antitermination protein nusG  33.33 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1699  NusG antitermination factor  25 
 
 		 212 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  24.14 
 
 		 179 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0470266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>