More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4226 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4226  NusG antitermination factor  100 
 
 
164 aa  333  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.841034  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  36.36 
 
 
188 aa  101  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  34.71 
 
 
175 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  33.92 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  32.39 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  33.92 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  33.13 
 
 
187 aa  95.5  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  32.57 
 
 
177 aa  94.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  32.56 
 
 
174 aa  92.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  34.5 
 
 
177 aa  91.7  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  34.5 
 
 
177 aa  91.7  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  34.5 
 
 
177 aa  90.9  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  33.14 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  33.92 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  31.4 
 
 
174 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  32.16 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  33.13 
 
 
194 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  33.92 
 
 
175 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  30.41 
 
 
175 aa  89.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  33.53 
 
 
175 aa  88.6  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  31.58 
 
 
176 aa  89  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  32.52 
 
 
194 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  32.16 
 
 
176 aa  88.6  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  32.16 
 
 
185 aa  88.2  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  33.14 
 
 
177 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  31.82 
 
 
243 aa  87.4  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2239  NusG antitermination factor  37.95 
 
 
179 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000688878  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  31.61 
 
 
183 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  32.09 
 
 
267 aa  86.3  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  32.16 
 
 
176 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  30.99 
 
 
176 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  33.94 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  32.37 
 
 
177 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  31.98 
 
 
201 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  30.64 
 
 
176 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  29.71 
 
 
190 aa  85.1  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  30.23 
 
 
176 aa  84.7  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  34.29 
 
 
185 aa  85.1  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  31.58 
 
 
176 aa  84.7  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  31.98 
 
 
177 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  30.06 
 
 
177 aa  84.3  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  31.98 
 
 
177 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  33.33 
 
 
175 aa  84  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  30.41 
 
 
185 aa  84  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  30.64 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  30.06 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  30.06 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0497  transcription termination/antitermination factor NusG  32.56 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  31.98 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  28.65 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  29.31 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  31.98 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1492  NusG antitermination factor  30.41 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.509367  normal  0.372591 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  30.06 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  31.98 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  31.98 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  31.98 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  31.98 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375303  normal  0.085047 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  30.46 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  31.98 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  30.41 
 
 
176 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  31.98 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  29.48 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  33.33 
 
 
176 aa  82  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  28 
 
 
179 aa  82  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  31.11 
 
 
185 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  33.93 
 
 
178 aa  82  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1920  NusG antitermination factor  29.76 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  hitchhiker  0.00427943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  30.6 
 
 
266 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  30.81 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  31.98 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  31.21 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  31.79 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  31.79 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  31.79 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  28.09 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  31.79 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  31.79 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  31.79 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  31.79 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  31.79 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  31.79 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  28.09 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4390  transcription antitermination protein NusG  31.21 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826486  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  31.21 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  0.000000000000240769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0172  NusG antitermination factor  30.06 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325102  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  30.99 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  31.21 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4477  transcription antitermination protein NusG  31.21 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00122338  hitchhiker  0.00131185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  31.21 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  33.33 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  30.81 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  30.06 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3174  transcription antitermination protein nusG  30.39 
 
 
185 aa  80.9  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  28.8 
 
 
192 aa  80.9  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  29.65 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0272  transcription antitermination protein NusG  31.4 
 
 
181 aa  80.9  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325159  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  30.11 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  28.32 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0205  transcription antitermination protein NusG  31.4 
 
 
181 aa  80.5  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000145742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>