162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0204 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0204  NusG antitermination factor  100 
 
 		 188 aa  381  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1362  NusG antitermination factor  60.12 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0821693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0849  NusG antitermination factor  56.65 
 
 		 173 aa  209  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2445  NusG antitermination factor  35.47 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.012878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12290  transcription antiterminator  34.68 
 
 		 169 aa  93.6  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1920  NusG antitermination factor  31.98 
 
 		 170 aa  91.7  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  hitchhiker  0.00427943 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1881  NusG antitermination factor  33.71 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.541166  hitchhiker  0.00000716942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2239  NusG antitermination factor  31.43 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000688878  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1880  NusG antitermination factor  30.06 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  hitchhiker  0.00000812866 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4226  NusG antitermination factor  26.16 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.841034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0744  transcription antitermination protein NusG  25.41 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000594191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04536  transcription antitermination protein NusG  24.59 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3454  NusG antitermination factor  23.46 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000805693  normal  0.0356218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1394  transcriptional acivator RfaH  26.52 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133861  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1665  NusG antitermination factor  24.32 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1702  NusG antitermination factor  29.67 
 
 		 196 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00942091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1938  NusG antitermination factor  25 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2991  transcription antitermination protein nusG  22.53 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2672  transcriptional activator RfaH  26.51 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000489964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  23.46 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  23.46 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  22.91 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4482  NusG antitermination factor  22.53 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000412602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  25.28 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00050  putative transcription antitermination protein  23.76 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1967  NusG antitermination factor  26.35 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.688216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  20.99 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  23.5 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  22.99 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  22.46 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1650  transcriptional acivator RfaH  26.06 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0204524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  25.14 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0357  NusG antitermination factor  26.71 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0844  transcription termination/antitermination factor NusG  24.02 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1636  NusG antitermination factor  32.88 
 
 		 85 aa  49.3  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1589  NusG antitermination factor  24.32 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262291  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  22.1 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0149  NusG antitermination factor  25.68 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114969  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0228  transcription antitermination protein nusG  24.57 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00207828  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1375  NusG antitermination factor  24.43 
 
 		 176 aa  48.5  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078055  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4702  NusG antitermination factor  21.11 
 
 		 183 aa  48.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000069225  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0283  NusG antitermination factor  22.78 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000819878  hitchhiker  0.00383281 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3174  transcription antitermination protein nusG  22.87 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1699  NusG antitermination factor  24.71 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3134  NusG antitermination factor  24.72 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1103  NusG antitermination factor  25.99 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00324857  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  26.26 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0389  transcription antitermination protein NusG  25.42 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  21.55 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2594  transcription antitermination protein nusG  24 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000665583  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2684  NusG antitermination factor  23.73 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000736005  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4329  NusG antitermination factor  21.98 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000065431  hitchhiker  0.00000000191931 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2182  NusG antitermination factor  21.47 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0729444  normal  0.026966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5306  NusG antitermination factor  25 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955236  normal  0.0968328 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4470  NusG antitermination factor  21.67 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0184  NusG antitermination factor  21.67 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410017  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0848  NusG antitermination factor  27.94 
 
 		 354 aa  45.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000981169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0188  NusG antitermination factor  21.67 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000173496  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4068  NusG antitermination factor  21.67 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000120393  hitchhiker  0.00918489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2803  NusG antitermination factor  24.26 
 
 		 207 aa  45.1  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3892  NGN domain protein  24.34 
 
 		 176 aa  45.1  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0965  NusG antitermination factor  25.33 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  24.31 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  21.55 
 
 		 177 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  21.55 
 
 		 177 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2265  transcriptional activator rfaH, putative  24.55 
 
 		 167 aa  45.1  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000106043  hitchhiker  0.00695369 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  24.1 
 
 		 198 aa  44.7  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0191  NusG antitermination factor  23.78 
 
 		 191 aa  44.7  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382089  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0237  NusG antitermination factor  24.04 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3605  NusG antitermination factor  25.29 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  hitchhiker  0.000423635 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0887  transcription antitermination protein nusG  25.17 
 
 		 182 aa  44.7  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.769632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3466  NusG antitermination factor  25.17 
 
 		 169 aa  44.7  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0172  NusG antitermination factor  22.78 
 
 		 183 aa  44.7  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325102  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0713  NusG family transcription antitermination protein  24.57 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0218939  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0219  transcription antitermination protein NusG  21.67 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004133  transcriptional activator RfaH  26.58 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1046  NusG antitermination factor  24.18 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  25.68 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0158  transcription termination/antitermination factor NusG  21.98 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000171251  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  25.13 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  25.13 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0187  transcription antitermination protein nusG  21.67 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000177465  hitchhiker  0.00840518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0182  transcription antitermination protein nusG  21.67 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000371558  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0187  transcription antitermination protein nusG  21.67 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000254051  normal  0.0190585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1469  transcriptional acivator RfaH  24.14 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000410204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3451  NusG antitermination factor  21.67 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0281776  normal  0.0124295 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3771  NusG antitermination factor  21.67 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  22.1 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  22.95 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2904  transcriptional acivator RfaH  24.14 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  24.18 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3036  transcriptional acivator RfaH  24.71 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00758207  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  20.11 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2112  transcription antitermination protein NusG  22.4 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000834658  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  20.43 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1892  transcription antitermination protein nusG  20.9 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.194693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2786  NusG antitermination factor  21.79 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000144907  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1321  transcription antitermination protein NusG  20.34 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000116235  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0146  NusG antitermination factor  21.11 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000173451  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3953  transcriptional activator RfaH  25.58 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.038453 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>