229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2627 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2627  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  469  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2482  hypothetical protein  98.68 
 
 
227 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1927  hypothetical protein  30.38 
 
 
223 aa  62.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
239 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
239 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
239 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
239 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  37.63 
 
 
239 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  37.63 
 
 
239 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.63 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  37.63 
 
 
239 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  37.63 
 
 
239 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  37.63 
 
 
239 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  37.63 
 
 
239 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  37.63 
 
 
239 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3710  LuxR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
426 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
244 aa  49.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 
254 aa  48.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2098  hypothetical protein  37.7 
 
 
154 aa  48.5  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0970  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
209 aa  48.5  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0307407  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  46.67 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  38.81 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.2 
 
 
213 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 
201 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 
201 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  35.48 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.38 
 
 
238 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.38 
 
 
394 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.38 
 
 
425 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00236991  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.38 
 
 
238 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.38 
 
 
238 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.38 
 
 
238 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.38 
 
 
238 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1549  LuxR transcriptional regulator  30.85 
 
 
201 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.152747 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  35.94 
 
 
235 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  42.62 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.62 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
554 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.62 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.62 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
202 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 
260 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0164  LuxR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
246 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0153554  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 
188 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
212 aa  46.2  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 
253 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2112  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.25 
 
 
836 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4334  response regulator receiver protein  26.17 
 
 
200 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574495  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  45.83 
 
 
211 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
309 aa  45.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
237 aa  45.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 
198 aa  45.4  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  28.72 
 
 
228 aa  45.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
211 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 
237 aa  45.1  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0852  transcriptional regulator, LuxR family  38.16 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
204 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4644  transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 
77 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03511  putative transcriptional regulator, LuxR family protein  34.67 
 
 
103 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0867403  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4137  regulatory protein LuxR  30.37 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.272227 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1849  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 
197 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0165336  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4278  regulatory protein, LuxR  36.07 
 
 
77 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61759  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  38.33 
 
 
911 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.58 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  24.59 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
260 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0440  transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 
526 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2120  LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0535979  normal  0.194929 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.56 
 
 
1453 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.52 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  31.15 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.66 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.45 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0929  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000567962  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3766  response regulator receiver protein  32.81 
 
 
539 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484632  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8454  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.16 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  hitchhiker  0.00000372445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 
243 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3504  DNA-binding transcriptional activator UhpA  27.61 
 
 
196 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  35.94 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1384  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0622  transcriptional regulator UhpA  30.86 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0502  regulatory protein, LuxR  40 
 
 
861 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0169233  normal  0.80601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>