More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1670 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 635 aa  1266    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  50.55 
 
 		 714 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  49.92 
 
 		 620 aa  559  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  56.52 
 
 		 606 aa  545  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  47.4 
 
 		 585 aa  524  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  47.95 
 
 		 585 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  49.22 
 
 		 620 aa  468  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  58.4 
 
 		 670 aa  432  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  46.21 
 
 		 661 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  41.4 
 
 		 581 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  43.67 
 
 		 584 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  42.19 
 
 		 564 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  51.34 
 
 		 684 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  45.14 
 
 		 547 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  51.9 
 
 		 640 aa  355  2e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  39.04 
 
 		 538 aa  310  4e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  45.56 
 
 		 674 aa  309  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  38.1 
 
 		 550 aa  291  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1341  preprotein translocase subunit SecD  46.7 
 
 		 605 aa  291  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.022847  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  44.3 
 
 		 566 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  45.87 
 
 		 603 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  41.16 
 
 		 680 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  35.74 
 
 		 573 aa  261  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  44.29 
 
 		 617 aa  259  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  45.38 
 
 		 599 aa  256  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  42.77 
 
 		 607 aa  256  9e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  41.64 
 
 		 653 aa  247  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  44.54 
 
 		 632 aa  246  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  48.26 
 
 		 649 aa  244  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  41.94 
 
 		 666 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  43.54 
 
 		 598 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  43.54 
 
 		 598 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  43.54 
 
 		 598 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  40.32 
 
 		 656 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  33.98 
 
 		 496 aa  231  4e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  33.62 
 
 		 457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  30.86 
 
 		 487 aa  189  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  30.36 
 
 		 900 aa  187  7e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  31.37 
 
 		 464 aa  182  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  32.62 
 
 		 525 aa  181  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.15 
 
 		 911 aa  178  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  29.96 
 
 		 977 aa  176  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  28.99 
 
 		 474 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  29.32 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  31.61 
 
 		 855 aa  176  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  28.75 
 
 		 487 aa  176  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  28.74 
 
 		 489 aa  174  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  28.89 
 
 		 489 aa  174  5e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.46 
 
 		 848 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.46 
 
 		 849 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  27.39 
 
 		 885 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  28.66 
 
 		 486 aa  171  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  29.7 
 
 		 470 aa  170  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  29.7 
 
 		 470 aa  170  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  29.39 
 
 		 471 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  33.98 
 
 		 403 aa  169  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  40.24 
 
 		 989 aa  168  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  31.29 
 
 		 532 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  28.25 
 
 		 470 aa  167  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  30.88 
 
 		 503 aa  167  8e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  29.53 
 
 		 531 aa  166  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  33.66 
 
 		 461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  30.11 
 
 		 531 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  27.99 
 
 		 495 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  29.3 
 
 		 495 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.23 
 
 		 981 aa  164  5.0000000000000005e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  30.29 
 
 		 533 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.19 
 
 		 853 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  29.85 
 
 		 493 aa  162  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  29.05 
 
 		 473 aa  161  3e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  29.77 
 
 		 533 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  29.15 
 
 		 532 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  27.65 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  29.09 
 
 		 533 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  32 
 
 		 533 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  29.46 
 
 		 416 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  27.33 
 
 		 472 aa  159  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  27.75 
 
 		 533 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  29.57 
 
 		 532 aa  158  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  27.58 
 
 		 508 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  30.77 
 
 		 533 aa  157  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  30.25 
 
 		 413 aa  157  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  28.45 
 
 		 533 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  31.8 
 
 		 406 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.33 
 
 		 856 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  32.2 
 
 		 534 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  31.71 
 
 		 622 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  30.39 
 
 		 535 aa  154  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  31.94 
 
 		 533 aa  154  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  30.7 
 
 		 735 aa  154  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  34.88 
 
 		 441 aa  153  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  37.74 
 
 		 537 aa  153  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  27.76 
 
 		 532 aa  153  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  27.1 
 
 		 489 aa  152  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  29.69 
 
 		 464 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  37.41 
 
 		 535 aa  151  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  27.58 
 
 		 843 aa  151  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.43 
 
 		 839 aa  150  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  31.61 
 
 		 411 aa  150  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  39.15 
 
 		 532 aa  150  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>