149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0248 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0248  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 524 aa  1084    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000541084  hitchhiker  0.00459613 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  54.47 
 
 		 526 aa  567  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  48.21 
 
 		 542 aa  473  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5133  Resolvase domain  42.89 
 
 		 539 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.880179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  26.08 
 
 		 513 aa  103  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  23.04 
 
 		 524 aa  100  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.88 
 
 		 415 aa  97.8  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.12 
 
 		 522 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3000  resolvase domain protein  21.58 
 
 		 549 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  25.54 
 
 		 493 aa  87  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  25.26 
 
 		 582 aa  86.7  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  24.13 
 
 		 743 aa  84  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  25.56 
 
 		 607 aa  83.2  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.47 
 
 		 546 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  26.06 
 
 		 534 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  22.05 
 
 		 542 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  22.05 
 
 		 542 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  21.73 
 
 		 542 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  26.35 
 
 		 534 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  23.39 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  26.35 
 
 		 534 aa  75.5  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  23.59 
 
 		 519 aa  75.1  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  26.35 
 
 		 534 aa  74.7  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  26.35 
 
 		 534 aa  74.3  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  26.06 
 
 		 534 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  25.7 
 
 		 537 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  25 
 
 		 509 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  26.75 
 
 		 546 aa  71.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.02 
 
 		 548 aa  71.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  24.28 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  25.7 
 
 		 537 aa  70.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  24.55 
 
 		 500 aa  70.1  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.4 
 
 		 510 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  23.94 
 
 		 564 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  24.94 
 
 		 490 aa  67.4  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  0.000000886482 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  22.58 
 
 		 550 aa  66.2  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  23.06 
 
 		 555 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.49 
 
 		 539 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.66 
 
 		 517 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  25.06 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  25.07 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  24.04 
 
 		 590 aa  63.9  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  24.19 
 
 		 544 aa  63.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  27.74 
 
 		 561 aa  63.5  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  25.07 
 
 		 528 aa  63.5  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  22.13 
 
 		 554 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.63 
 
 		 546 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  22.25 
 
 		 542 aa  62.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  21.52 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.13 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  25.14 
 
 		 516 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  22.77 
 
 		 565 aa  61.6  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  29.27 
 
 		 295 aa  62  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  28.52 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  21.96 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25.16 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  23.27 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  22.56 
 
 		 540 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  24.25 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  23.03 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.34 
 
 		 485 aa  59.3  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  23.23 
 
 		 475 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0976  resolvase-like protein  54.39 
 
 		 72 aa  58.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.735809 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  27.3 
 
 		 689 aa  58.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  27.3 
 
 		 689 aa  58.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  21.26 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  21.57 
 
 		 521 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  24.4 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  24.58 
 
 		 458 aa  57  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  22.54 
 
 		 445 aa  57  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  22.19 
 
 		 498 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  24.27 
 
 		 550 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  22.88 
 
 		 613 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  22.07 
 
 		 539 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  24.64 
 
 		 555 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  22.83 
 
 		 525 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 283 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  20.36 
 
 		 558 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  23.21 
 
 		 551 aa  55.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  24.54 
 
 		 531 aa  55.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3800  hypothetical protein  84.85 
 
 		 116 aa  55.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.316037  normal  0.357986 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  22.88 
 
 		 551 aa  54.7  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  22.31 
 
 		 579 aa  54.7  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  22.13 
 
 		 540 aa  54.7  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  22 
 
 		 525 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  22.41 
 
 		 547 aa  54.3  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  23.55 
 
 		 522 aa  53.9  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  21.1 
 
 		 612 aa  53.9  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  22.22 
 
 		 662 aa  53.9  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  23.68 
 
 		 458 aa  53.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  24.83 
 
 		 525 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  23.28 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  24.83 
 
 		 525 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  29.25 
 
 		 563 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  23.51 
 
 		 626 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  25 
 
 		 475 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  22.27 
 
 		 551 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  22.48 
 
 		 568 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4704  recombinase  24.59 
 
 		 689 aa  51.2  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.172912 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>