186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4704 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4640  recombinase  100 
 
 		 689 aa  1410    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4704  recombinase  100 
 
 		 689 aa  1410    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.172912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0415  recombinase  100 
 
 		 689 aa  1410    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.030164 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  70.45 
 
 		 689 aa  1007    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  70.45 
 
 		 689 aa  1007    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3901  recombinase  42.84 
 
 		 689 aa  503  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0165  excisionase/Xis, DNA-binding  43.89 
 
 		 685 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4395  resolvase-like protein  42.17 
 
 		 617 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3392  resolvase domain-containing protein  39.09 
 
 		 689 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7609  resolvase domain-containing protein  33.92 
 
 		 690 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918322 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4855  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 694 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0344697  normal  0.666269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4901  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 694 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.954414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7439  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 694 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7628  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 694 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6949  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 694 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1378  transposon orf3  36.16 
 
 		 694 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2790  recombinase  33.33 
 
 		 692 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.359008  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8022  hypothetical protein  65.83 
 
 		 279 aa  327  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0458  resolvase domain-containing protein  39.19 
 
 		 722 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2088  recombinase  36.42 
 
 		 829 aa  304  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.929661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0282  resolvase-like protein  81.56 
 
 		 184 aa  301  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6777  resolvase domain-containing protein  40.09 
 
 		 656 aa  256  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3290  resolvase domain-containing protein  28.31 
 
 		 579 aa  253  7e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8272  insertion sequence ATP-binding protein  69.64 
 
 		 169 aa  244  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.675942  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0338  Resolvase domain protein  40.68 
 
 		 385 aa  226  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0236836  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4797  Resolvase domain protein  40.68 
 
 		 385 aa  226  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3478  hypothetical protein  44.78 
 
 		 153 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.271395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  28.75 
 
 		 485 aa  88.2  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3073  hypothetical protein  52.27 
 
 		 125 aa  88.2  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706022  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3511  hypothetical protein  38.52 
 
 		 234 aa  87.8  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161904  normal  0.581305 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  23.99 
 
 		 528 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  23.49 
 
 		 517 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  24.1 
 
 		 528 aa  80.9  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  23.29 
 
 		 527 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  26.09 
 
 		 516 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  30.14 
 
 		 546 aa  75.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  26.09 
 
 		 516 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  26.11 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  24.19 
 
 		 534 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  26.21 
 
 		 545 aa  73.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  26.11 
 
 		 534 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  25.28 
 
 		 534 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  25.56 
 
 		 534 aa  72.4  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  25.56 
 
 		 534 aa  72  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  25.39 
 
 		 465 aa  72  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  25.43 
 
 		 550 aa  70.9  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.14 
 
 		 534 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  24.48 
 
 		 568 aa  70.1  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  25.28 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1691  resolvase domain-containing protein  21.55 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0333311  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  24.07 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  24.92 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  28.44 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  24.72 
 
 		 537 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  25.4 
 
 		 522 aa  67  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  23.16 
 
 		 447 aa  67  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  28.37 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.3 
 
 		 542 aa  65.1  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.3 
 
 		 542 aa  65.1  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.3 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  25.14 
 
 		 539 aa  64.7  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  25.73 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  24.47 
 
 		 540 aa  64.3  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  23.3 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1501  hypothetical protein  24.92 
 
 		 512 aa  63.5  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.420622  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  27 
 
 		 445 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  25.37 
 
 		 505 aa  63.5  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  23.81 
 
 		 462 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  26.61 
 
 		 509 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.6 
 
 		 522 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  26.53 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  22.09 
 
 		 484 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  25.36 
 
 		 525 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  27 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4608  DNA recombinase, putative  23.21 
 
 		 511 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  24.48 
 
 		 506 aa  62  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  24.73 
 
 		 540 aa  61.6  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  26.6 
 
 		 537 aa  61.2  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  22.35 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  22.57 
 
 		 606 aa  60.8  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  22.57 
 
 		 606 aa  60.8  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  22.92 
 
 		 580 aa  60.5  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  25.43 
 
 		 475 aa  60.1  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  25.07 
 
 		 525 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  22.76 
 
 		 449 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  22.76 
 
 		 449 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  27.22 
 
 		 494 aa  60.1  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  23.6 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  28.85 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  21.05 
 
 		 500 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  28.85 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  28.85 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  21.81 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  24.67 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  22.9 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  24.49 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.56 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  23.91 
 
 		 498 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.41 
 
 		 586 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  27.69 
 
 		 295 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>