More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4800 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  726    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  79 
 
 		 330 aa  510  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  78.55 
 
 		 331 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  72.43 
 
 		 334 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  68.73 
 
 		 330 aa  462  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  69.44 
 
 		 335 aa  461  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  71.1 
 
 		 335 aa  463  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  70.1 
 
 		 335 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  55.68 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  55.56 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  52.1 
 
 		 328 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  51.94 
 
 		 328 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  53.92 
 
 		 324 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  56.86 
 
 		 324 aa  342  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  51.86 
 
 		 327 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  53.27 
 
 		 325 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  52.32 
 
 		 325 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  52.6 
 
 		 328 aa  335  7e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  54.33 
 
 		 328 aa  332  6e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  53.33 
 
 		 327 aa  332  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  51.42 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  53.57 
 
 		 330 aa  325  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  53.27 
 
 		 325 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  53.8 
 
 		 323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  50.46 
 
 		 328 aa  315  6e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  53 
 
 		 329 aa  315  8e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  49.67 
 
 		 327 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  50.65 
 
 		 329 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  47.33 
 
 		 332 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  49.17 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  49.17 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  48.11 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  46.18 
 
 		 329 aa  282  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  44.44 
 
 		 331 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  44.44 
 
 		 331 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3883  hypothetical protein  44.48 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  45.12 
 
 		 331 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  43.26 
 
 		 337 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.22 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  40.95 
 
 		 323 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.38 
 
 		 330 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  42.47 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.19 
 
 		 324 aa  255  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.49 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  44.51 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2035  hypothetical protein  41.02 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  40.98 
 
 		 330 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3797  hypothetical protein  41.58 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  42.23 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  42.23 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.46 
 
 		 326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  41.81 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.31 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  41.53 
 
 		 328 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.19 
 
 		 328 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  41.86 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.26 
 
 		 336 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  39.29 
 
 		 335 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.68 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.33 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.41 
 
 		 349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  40.39 
 
 		 327 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4008  hypothetical protein  41.84 
 
 		 335 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  39.29 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.48 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  38.87 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.21 
 
 		 336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.59 
 
 		 331 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  42 
 
 		 326 aa  232  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  39 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  40.27 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.53 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.53 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  39.18 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  39.18 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.33 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.38 
 
 		 336 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.64 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.33 
 
 		 328 aa  229  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.96 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  40.78 
 
 		 329 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  41.12 
 
 		 321 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.54 
 
 		 330 aa  229  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  36.04 
 
 		 698 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.53 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.38 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  39.93 
 
 		 327 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  39.67 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  39.53 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  39.81 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  38.67 
 
 		 322 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  35.76 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  38.53 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  39.22 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0970  hypothetical protein  36.65 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  38.93 
 
 		 330 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39 
 
 		 327 aa  222  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39 
 
 		 325 aa  222  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.22 
 
 		 328 aa  222  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  37.25 
 
 		 343 aa  222  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>