More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4745 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4745  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  625  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.729487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4100  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 303 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4579  LysR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 303 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1310  LysR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 303 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000494191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3879  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3195  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 363 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37220  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 317 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4170  LysR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 349 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4692  LysR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3815  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0927  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 348 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5498  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 345 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3582  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283353  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4785  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3458  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5281  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 311 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2365  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3549  LysR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3970  LysR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5126  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 310 aa  175  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0428454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2577  LysR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571324  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1096  transcriptional regulator, LysR family  37.13 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000448558  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4978  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2124  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 297 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.01237  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4814  transcriptional regulator, LysR family  36.48 
 
 		 312 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274542 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1845  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.136314  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1946  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 316 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 321 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3622  LysR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2882  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 320 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130369 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0007  LysR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1507  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3349  LysR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3045  LysR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458337  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3400  LysR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 296 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0974424  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4149  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.438214  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1775  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0671659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0474  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0007  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2263  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2466  LysR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 311 aa  119  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3293  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3079  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149584  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2257  transcriptional regulator, LysR family  29.19 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2571  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  29.81 
 
 		 314 aa  98.2  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5799  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 332 aa  95.5  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0236  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  27.31 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1231  transcriptional regulator, LysR family  31.11 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.214878  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3151  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0888  transcriptional regulator, LysR family  26.57 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3352  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00848544  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0880  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 295 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302502 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0076  transcriptional regulator, LysR family  29.74 
 
 		 302 aa  89.4  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1733  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3833  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0960  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0896  LysR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.204372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  28.74 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2785  transcriptional regulator, LysR family  25.2 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  27.59 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3933  transcriptional regulator, LysR family  26 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2901  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 325 aa  85.9  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0129461 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3199  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 297 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0827152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3810  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430923 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1892  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0154443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1911  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0709  transcriptional regulator OxyR, putative  26.95 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4555  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.74 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  23.05 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0770  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2122  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2253  transcriptional regulator, LysR family  28.41 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105468  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  26.69 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5695  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.31 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3927  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3312  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00186947  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1151  transcriptional regulator, LysR family  26.64 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  27.97 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6251  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0665  putative transcriptional regulator OxyR  26.56 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1341  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545162  normal  0.0460764 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1363  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450515  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  29.39 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>