More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1426 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1426  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
514 aa  990    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1220  carbohydrate kinase, YjeF related protein  63.64 
 
 
505 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2588  carbohydrate kinase, YjeF related protein  64.22 
 
 
508 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.236021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1821  carbohydrate kinase, YjeF related protein  61.26 
 
 
524 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.99 
 
 
517 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1984  hypothetical protein  58.88 
 
 
487 aa  435  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2698  hypothetical protein  56.63 
 
 
523 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.391091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2596  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.37 
 
 
486 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4950  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.54 
 
 
525 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.433467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1982  hypothetical protein  51.79 
 
 
510 aa  341  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0776556 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2854  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.21 
 
 
548 aa  312  9e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.212974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.5 
 
 
529 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  43.29 
 
 
526 aa  280  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  45.45 
 
 
535 aa  277  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.56 
 
 
531 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  44.05 
 
 
531 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5217  hypothetical protein  46.37 
 
 
514 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.43 
 
 
531 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6163  hypothetical protein  44.91 
 
 
514 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2307  nitric-oxide reductase subunit C  45.29 
 
 
531 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1916  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.91 
 
 
514 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194731  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1214  putative carbohydrate kinase  45.29 
 
 
531 aa  269  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1448  carbohydrate kinase, putative  45.29 
 
 
531 aa  269  8e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2346  carbohydrate kinase family protein  45.29 
 
 
531 aa  269  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121214  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3364  putative carbohydrate kinase  45.29 
 
 
531 aa  269  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.36405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1941  putative carbohydrate kinase  45.29 
 
 
531 aa  269  8e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2465  sugar kinase  45.09 
 
 
531 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  43.34 
 
 
533 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1020  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.4 
 
 
530 aa  264  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1939  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.34 
 
 
514 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643573  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.74 
 
 
514 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2133  carbohydrate kinase, putative  45.29 
 
 
531 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.217143  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1358  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.92 
 
 
514 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624281  normal  0.973105 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1834  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.02 
 
 
514 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  39 
 
 
506 aa  232  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  37.71 
 
 
522 aa  232  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.26 
 
 
515 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  37.26 
 
 
510 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  37.26 
 
 
510 aa  226  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  37.26 
 
 
515 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  37.07 
 
 
515 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  37.48 
 
 
515 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  37.26 
 
 
515 aa  224  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  37.48 
 
 
515 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  40.97 
 
 
487 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  37.07 
 
 
510 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  36.99 
 
 
514 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.99 
 
 
499 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  36.99 
 
 
514 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  36.99 
 
 
514 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  36.99 
 
 
514 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  36.99 
 
 
514 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.6 
 
 
502 aa  217  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.04 
 
 
513 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  36.51 
 
 
504 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  36.31 
 
 
504 aa  209  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  36.31 
 
 
504 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  41.74 
 
 
482 aa  204  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  33.27 
 
 
498 aa  197  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.94 
 
 
499 aa  196  7e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  36.23 
 
 
513 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  32.35 
 
 
492 aa  194  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  33.86 
 
 
508 aa  194  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  36.72 
 
 
510 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  36.15 
 
 
514 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.19 
 
 
509 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.76 
 
 
490 aa  190  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  32.6 
 
 
490 aa  188  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  36.9 
 
 
462 aa  189  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  33.6 
 
 
512 aa  188  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  34.35 
 
 
503 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.52 
 
 
504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  36.4 
 
 
496 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  33.27 
 
 
496 aa  183  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.11 
 
 
515 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
492 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  37.5 
 
 
499 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.49 
 
 
488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.33 
 
 
494 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  31.06 
 
 
517 aa  178  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  36.76 
 
 
502 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  37.55 
 
 
495 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.25 
 
 
492 aa  176  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  34.78 
 
 
499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.22 
 
 
499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.19 
 
 
520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2019  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.86 
 
 
520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000259128  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.53 
 
 
494 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  39.25 
 
 
496 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  38.35 
 
 
500 aa  173  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.23 
 
 
499 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  32.61 
 
 
513 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
494 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.93 
 
 
494 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  34.33 
 
 
436 aa  171  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.75 
 
 
513 aa  171  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  33.2 
 
 
494 aa  171  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.27 
 
 
499 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  33.26 
 
 
492 aa  170  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  30.24 
 
 
524 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>