More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2854 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2854  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 548 aa  1053    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.212974 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1982  hypothetical protein  51.29 
 
 		 510 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776556 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1426  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.42 
 
 		 514 aa  330  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.48 
 
 		 517 aa  330  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2698  hypothetical protein  53.94 
 
 		 523 aa  324  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.391091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2596  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.65 
 
 		 486 aa  310  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  46.25 
 
 		 535 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1984  hypothetical protein  52.24 
 
 		 487 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.76 
 
 		 531 aa  276  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1821  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.64 
 
 		 524 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.53 
 
 		 531 aa  273  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  43.76 
 
 		 526 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4950  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.98 
 
 		 525 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  42.61 
 
 		 531 aa  265  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2588  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.49 
 
 		 508 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.236021 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1220  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.28 
 
 		 505 aa  262  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  40.75 
 
 		 506 aa  256  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.03 
 
 		 529 aa  256  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5217  hypothetical protein  44.27 
 
 		 514 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2346  carbohydrate kinase family protein  42.91 
 
 		 531 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1448  carbohydrate kinase, putative  42.91 
 
 		 531 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3364  putative carbohydrate kinase  42.91 
 
 		 531 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.36405  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1214  putative carbohydrate kinase  42.91 
 
 		 531 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6163  hypothetical protein  44.6 
 
 		 514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1916  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.6 
 
 		 514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1941  putative carbohydrate kinase  42.91 
 
 		 531 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2465  sugar kinase  42.91 
 
 		 531 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2307  nitric-oxide reductase subunit C  42.83 
 
 		 531 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  38.17 
 
 		 522 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2133  carbohydrate kinase, putative  44.94 
 
 		 531 aa  232  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.217143  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  37.67 
 
 		 533 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1939  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.79 
 
 		 514 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.37 
 
 		 514 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.6 
 
 		 513 aa  225  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1834  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.9 
 
 		 514 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1020  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.26 
 
 		 530 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  41.39 
 
 		 487 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  34.32 
 
 		 498 aa  206  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1358  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.81 
 
 		 514 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624281  normal  0.973105 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.84 
 
 		 509 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  36.51 
 
 		 510 aa  202  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.69 
 
 		 499 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  36.23 
 
 		 514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.38 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  34.4 
 
 		 510 aa  197  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  34.2 
 
 		 510 aa  194  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  38.05 
 
 		 502 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34 
 
 		 515 aa  193  9e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  33.8 
 
 		 515 aa  192  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  34 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  34.75 
 
 		 515 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  34.75 
 
 		 515 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.98 
 
 		 504 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  32.68 
 
 		 490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.04 
 
 		 510 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  34.2 
 
 		 515 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.92 
 
 		 513 aa  191  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  34.2 
 
 		 515 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  33.81 
 
 		 488 aa  190  5.999999999999999e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.8 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  33.66 
 
 		 508 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  36.47 
 
 		 436 aa  189  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  35.09 
 
 		 514 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  35.09 
 
 		 514 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  35.09 
 
 		 514 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  35.09 
 
 		 514 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  36.63 
 
 		 503 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  35.09 
 
 		 514 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.97 
 
 		 492 aa  187  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  33.81 
 
 		 486 aa  187  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.52 
 
 		 502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  39.45 
 
 		 499 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  39.87 
 
 		 502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.37 
 
 		 490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.04 
 
 		 494 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  40.05 
 
 		 482 aa  183  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.69 
 
 		 524 aa  182  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.17 
 
 		 524 aa  182  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.57 
 
 		 504 aa  182  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  36.53 
 
 		 513 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  38.36 
 
 		 496 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  34.56 
 
 		 512 aa  181  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  38.31 
 
 		 496 aa  179  8e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.16 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.81 
 
 		 533 aa  179  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.91 
 
 		 492 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  32.37 
 
 		 524 aa  177  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  39.52 
 
 		 495 aa  178  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  31.62 
 
 		 499 aa  178  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  35.42 
 
 		 504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  39.92 
 
 		 500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.99 
 
 		 500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.82 
 
 		 492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  35.21 
 
 		 504 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  35.4 
 
 		 462 aa  173  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  35.42 
 
 		 504 aa  173  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  33.76 
 
 		 513 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.95 
 
 		 496 aa  172  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.51 
 
 		 479 aa  172  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.46 
 
 		 514 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>