More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1982 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1982  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  974    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.49 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1426  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.99 
 
 		 514 aa  362  7.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2854  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.52 
 
 		 548 aa  355  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.212974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2698  hypothetical protein  52.11 
 
 		 523 aa  350  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.391091 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1984  hypothetical protein  55.02 
 
 		 487 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4950  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.38 
 
 		 525 aa  339  5.9999999999999996e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1821  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.83 
 
 		 524 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2596  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.97 
 
 		 486 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.25 
 
 		 529 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.18 
 
 		 531 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.86 
 
 		 531 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  45.89 
 
 		 531 aa  291  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  45 
 
 		 526 aa  289  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  45.63 
 
 		 535 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1220  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.77 
 
 		 505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2588  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.97 
 
 		 508 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.236021 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1020  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.85 
 
 		 530 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2307  nitric-oxide reductase subunit C  44.96 
 
 		 531 aa  269  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1214  putative carbohydrate kinase  44.96 
 
 		 531 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1448  carbohydrate kinase, putative  44.96 
 
 		 531 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3364  putative carbohydrate kinase  44.96 
 
 		 531 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.36405  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  41.43 
 
 		 533 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2346  carbohydrate kinase family protein  44.96 
 
 		 531 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1941  putative carbohydrate kinase  44.96 
 
 		 531 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2465  sugar kinase  44.75 
 
 		 531 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5217  hypothetical protein  46.39 
 
 		 514 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6163  hypothetical protein  45.53 
 
 		 514 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1916  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.53 
 
 		 514 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194731  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  41.99 
 
 		 506 aa  264  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.2 
 
 		 514 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2133  carbohydrate kinase, putative  44.75 
 
 		 531 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.217143  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  42.56 
 
 		 522 aa  256  5e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1834  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.8 
 
 		 514 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.2 
 
 		 513 aa  250  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1939  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.6 
 
 		 514 aa  249  9e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  44.37 
 
 		 487 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1358  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.51 
 
 		 514 aa  230  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624281  normal  0.973105 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.46 
 
 		 502 aa  218  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  37.35 
 
 		 510 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  34.6 
 
 		 498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  38.75 
 
 		 514 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  38.74 
 
 		 503 aa  213  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  40.26 
 
 		 462 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.85 
 
 		 515 aa  209  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  37.17 
 
 		 515 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  36.85 
 
 		 510 aa  209  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  36.97 
 
 		 515 aa  209  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  36.61 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  37.17 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  37.17 
 
 		 515 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  41.97 
 
 		 482 aa  207  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  38.91 
 
 		 513 aa  207  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  37.37 
 
 		 515 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  37.37 
 
 		 515 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.76 
 
 		 490 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.62 
 
 		 513 aa  205  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.95 
 
 		 499 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  36.66 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  36.66 
 
 		 514 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  36.66 
 
 		 514 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  36.66 
 
 		 514 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  37.26 
 
 		 504 aa  203  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.74 
 
 		 499 aa  203  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  36.46 
 
 		 514 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  37.05 
 
 		 504 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  37.26 
 
 		 504 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.47 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  35.14 
 
 		 488 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  31.92 
 
 		 490 aa  196  7e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.47 
 
 		 524 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  35.34 
 
 		 486 aa  196  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.11 
 
 		 520 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.4 
 
 		 494 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.49 
 
 		 492 aa  194  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  33.07 
 
 		 513 aa  193  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  35.74 
 
 		 508 aa  193  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.61 
 
 		 533 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  38.03 
 
 		 502 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  32.63 
 
 		 512 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.2 
 
 		 494 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.8 
 
 		 494 aa  190  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  34.48 
 
 		 493 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34 
 
 		 494 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.22 
 
 		 504 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.8 
 
 		 494 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  36.47 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  31.71 
 
 		 517 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  39.54 
 
 		 502 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  33.94 
 
 		 493 aa  187  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.02 
 
 		 496 aa  186  6e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  38.05 
 
 		 495 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  38.56 
 
 		 496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  26.78 
 
 		 499 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.74 
 
 		 479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  33.04 
 
 		 492 aa  181  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  33.66 
 
 		 499 aa  179  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.84 
 
 		 509 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.75 
 
 		 524 aa  179  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  34.71 
 
 		 496 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>