More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2698 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  71.4 
 
 		 517 aa  667    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2698  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1040    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.391091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1426  carbohydrate kinase, YjeF related protein  56.63 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1984  hypothetical protein  59.73 
 
 		 487 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2596  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.22 
 
 		 486 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1821  carbohydrate kinase, YjeF related protein  57.22 
 
 		 524 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4950  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.18 
 
 		 525 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433467 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1220  carbohydrate kinase, YjeF related protein  57.61 
 
 		 505 aa  369  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2588  carbohydrate kinase, YjeF related protein  57.61 
 
 		 508 aa  359  6e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.236021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1982  hypothetical protein  51.15 
 
 		 510 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776556 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2854  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.09 
 
 		 548 aa  319  7.999999999999999e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.212974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.71 
 
 		 529 aa  291  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  44.76 
 
 		 526 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  44.84 
 
 		 535 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  41.1 
 
 		 522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.83 
 
 		 531 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.87 
 
 		 531 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  43.06 
 
 		 531 aa  272  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1448  carbohydrate kinase, putative  44.06 
 
 		 531 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1214  putative carbohydrate kinase  44.06 
 
 		 531 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2346  carbohydrate kinase family protein  44.06 
 
 		 531 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1941  putative carbohydrate kinase  44.06 
 
 		 531 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2307  nitric-oxide reductase subunit C  44.06 
 
 		 531 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3364  putative carbohydrate kinase  44.06 
 
 		 531 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.36405  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2465  sugar kinase  43.85 
 
 		 531 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2133  carbohydrate kinase, putative  45.81 
 
 		 531 aa  256  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.217143  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.1 
 
 		 514 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5217  hypothetical protein  43.69 
 
 		 514 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  41.03 
 
 		 533 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6163  hypothetical protein  43.47 
 
 		 514 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1916  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.47 
 
 		 514 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194731  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1834  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.51 
 
 		 514 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  38.83 
 
 		 506 aa  243  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1939  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.66 
 
 		 514 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1020  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.32 
 
 		 530 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.86 
 
 		 515 aa  232  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  35.67 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  35.67 
 
 		 515 aa  229  9e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  36.02 
 
 		 510 aa  229  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.74 
 
 		 513 aa  228  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  35.36 
 
 		 515 aa  227  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  35.82 
 
 		 510 aa  227  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  35.36 
 
 		 515 aa  226  9e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  35.36 
 
 		 515 aa  226  9e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  41.73 
 
 		 482 aa  224  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  41.31 
 
 		 487 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  36.53 
 
 		 510 aa  224  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  36.45 
 
 		 514 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  36.45 
 
 		 514 aa  223  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  36.45 
 
 		 514 aa  223  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  36.45 
 
 		 514 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  36.45 
 
 		 514 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  35.26 
 
 		 504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  35.45 
 
 		 504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1358  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.18 
 
 		 514 aa  220  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624281  normal  0.973105 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  35.45 
 
 		 504 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  33.52 
 
 		 508 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  36.28 
 
 		 503 aa  206  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.32 
 
 		 499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.04 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  34.36 
 
 		 498 aa  196  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  38.64 
 
 		 496 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.6 
 
 		 499 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  37.09 
 
 		 513 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  35.56 
 
 		 510 aa  193  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  32.25 
 
 		 490 aa  192  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  34.77 
 
 		 514 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  36.22 
 
 		 462 aa  190  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.64 
 
 		 502 aa  189  9e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.03 
 
 		 504 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.6 
 
 		 513 aa  181  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  36.82 
 
 		 499 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  35.4 
 
 		 496 aa  179  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  37.52 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.47 
 
 		 494 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.09 
 
 		 494 aa  177  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  31.9 
 
 		 512 aa  176  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.7 
 
 		 492 aa  176  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  38.85 
 
 		 496 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  35.46 
 
 		 512 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  33.71 
 
 		 513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.2 
 
 		 494 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.85 
 
 		 496 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  37.08 
 
 		 502 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.07 
 
 		 494 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.18 
 
 		 510 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  36.73 
 
 		 436 aa  171  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.67 
 
 		 494 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  36.92 
 
 		 496 aa  170  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  35.61 
 
 		 495 aa  169  9e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  34.58 
 
 		 499 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.88 
 
 		 499 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  33.06 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  32.31 
 
 		 522 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  30.49 
 
 		 499 aa  166  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  33.6 
 
 		 488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  29.79 
 
 		 524 aa  164  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.32 
 
 		 500 aa  164  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.46 
 
 		 499 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  33.81 
 
 		 486 aa  164  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>