More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1220 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1220  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 505 aa  972    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2588  carbohydrate kinase, YjeF related protein  97.43 
 
 		 508 aa  794    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.236021 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1426  carbohydrate kinase, YjeF related protein  62.98 
 
 		 514 aa  533  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1821  carbohydrate kinase, YjeF related protein  65.42 
 
 		 524 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  56.98 
 
 		 517 aa  455  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2596  carbohydrate kinase, YjeF related protein  60.56 
 
 		 486 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4950  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.91 
 
 		 525 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1984  hypothetical protein  59.06 
 
 		 487 aa  428  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2698  hypothetical protein  57.61 
 
 		 523 aa  425  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.391091 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1982  hypothetical protein  53.78 
 
 		 510 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776556 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2854  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.3 
 
 		 548 aa  310  5e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.212974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.91 
 
 		 529 aa  292  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.37 
 
 		 531 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.17 
 
 		 531 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  44.19 
 
 		 535 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  43.55 
 
 		 531 aa  264  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6163  hypothetical protein  47.18 
 
 		 514 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1916  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.18 
 
 		 514 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194731  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  43.93 
 
 		 526 aa  263  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2346  carbohydrate kinase family protein  44.78 
 
 		 531 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1448  carbohydrate kinase, putative  44.78 
 
 		 531 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1214  putative carbohydrate kinase  44.78 
 
 		 531 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3364  putative carbohydrate kinase  44.78 
 
 		 531 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.36405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1941  putative carbohydrate kinase  44.78 
 
 		 531 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5217  hypothetical protein  45.64 
 
 		 514 aa  262  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2307  nitric-oxide reductase subunit C  44.78 
 
 		 531 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2465  sugar kinase  44.58 
 
 		 531 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  41.87 
 
 		 533 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2133  carbohydrate kinase, putative  45.49 
 
 		 531 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.217143  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1939  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.89 
 
 		 514 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.09 
 
 		 514 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1020  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.55 
 
 		 530 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1834  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.42 
 
 		 514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  40.22 
 
 		 522 aa  226  7e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1358  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.54 
 
 		 514 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624281  normal  0.973105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  36.65 
 
 		 514 aa  223  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  36.65 
 
 		 514 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  36.65 
 
 		 514 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  36.65 
 
 		 514 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  36.65 
 
 		 514 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  36.91 
 
 		 510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.91 
 
 		 515 aa  221  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  36.91 
 
 		 510 aa  221  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  37.1 
 
 		 515 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  38.21 
 
 		 506 aa  219  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  37.1 
 
 		 515 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  36.91 
 
 		 515 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  36.91 
 
 		 515 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  36.72 
 
 		 510 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  36.29 
 
 		 515 aa  217  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  41.49 
 
 		 487 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  37.1 
 
 		 504 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  36.9 
 
 		 504 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  37.9 
 
 		 510 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  36.9 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  37.52 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  37.74 
 
 		 503 aa  210  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  37.93 
 
 		 514 aa  206  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  34.09 
 
 		 508 aa  206  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.69 
 
 		 499 aa  204  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  39.39 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.44 
 
 		 513 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.94 
 
 		 502 aa  196  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  33.68 
 
 		 498 aa  186  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  35.06 
 
 		 512 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  40.54 
 
 		 482 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  32.99 
 
 		 524 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.49 
 
 		 490 aa  182  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  36.73 
 
 		 499 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  34.52 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  33.76 
 
 		 513 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  34.3 
 
 		 500 aa  180  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.54 
 
 		 492 aa  179  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.97 
 
 		 509 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.77 
 
 		 499 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.55 
 
 		 494 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.34 
 
 		 494 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  36.33 
 
 		 496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  32.34 
 
 		 490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  37.82 
 
 		 502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.57 
 
 		 493 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  33.54 
 
 		 488 aa  172  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.15 
 
 		 496 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  30.95 
 
 		 517 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.14 
 
 		 494 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  39.45 
 
 		 496 aa  171  3e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  37.43 
 
 		 502 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  36.98 
 
 		 495 aa  170  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.14 
 
 		 494 aa  170  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  33.54 
 
 		 486 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  34.71 
 
 		 499 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.88 
 
 		 504 aa  167  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  39.07 
 
 		 500 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.11 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  34.54 
 
 		 493 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.13 
 
 		 499 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.88 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  34.54 
 
 		 493 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.93 
 
 		 499 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.81 
 
 		 508 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>