More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0016 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 267 aa  549  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  50.2 
 
 		 292 aa  258  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  49.23 
 
 		 273 aa  257  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 275 aa  138  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  35.32 
 
 		 268 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  34.52 
 
 		 268 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  30.4 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  33.87 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  27.89 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 266 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  31.85 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  28.85 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  29.88 
 
 		 247 aa  96.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  25.58 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 275 aa  92.4  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  30.73 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 269 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  27.2 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  27.73 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  25.49 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  25.86 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  27.44 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  52.31 
 
 		 879 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3265  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 74 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 522 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3732  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23080  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.48 
 
 		 545 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.865531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0666  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3675  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0593  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858162  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0108  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 493 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.44109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  51.72 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.58 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3858  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0335499 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2048  transcriptional regulator, LuxR family  53.7 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 229 aa  53.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.31 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2655  transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 470 aa  52.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.149331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.11 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2103  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 210 aa  52.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1484  response regulator  38.6 
 
 		 212 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.923295  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3263  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 188 aa  52.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 372 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2191  transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1062  transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0597  transcriptional regulator, LuxR family  36.25 
 
 		 493 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.882562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 203 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4114  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 208 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0576718  normal  0.109105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4160  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0201669  normal  0.0925574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>