197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2430 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 252 aa  487  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  42.63 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  39.52 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  39.3 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 265 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  37.55 
 
 		 239 aa  131  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 229 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  34.98 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 250 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 250 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 250 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  41.13 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  40.61 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  37.06 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 304 aa  95.5  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  35.17 
 
 		 272 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 315 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  32.16 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 272 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  36.17 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  38.79 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  30.93 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  31.98 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  34.36 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 342 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 224 aa  72  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  27.85 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  37.4 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  29.64 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  30.59 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  29.96 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19920  transcriptional regulator, tetR family  29.17 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314765  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  37.6 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  28.47 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 195 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>