150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1210 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1210  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  438  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0313613  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  34.98 
 
 		 204 aa  131  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  32.07 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  32.26 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32400  transcriptional regulator, tetR family  38.71 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  27.83 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  41.94 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2716  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0607966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  34.04 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2963  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  24.87 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 497 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  25.33 
 
 		 245 aa  45.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 193 aa  45.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  31.52 
 
 		 193 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 248 aa  45.1  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  36 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  39.29 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  26.75 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  43.48 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  45.45 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  45.45 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  45.45 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 271 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  45.45 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  42.59 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>