225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1595 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1595  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 262 aa  531  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3830  extracellular solute-binding protein  36.95 
 
 		 248 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000366277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0424  hypothetical protein  38.84 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0629  extracellular solute-binding protein  40.19 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1208  hypothetical protein  34.27 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000699317  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1009  hypothetical protein  37.22 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.815562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0350  extracellular solute-binding protein family 3  31.36 
 
 		 321 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0133156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3031  extracellular solute-binding protein family 3  32.73 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1477  extracellular solute-binding protein family 3  33.86 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0258  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2767  extracellular solute-binding protein family 3  32.73 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3188  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  33.33 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1005  hypothetical protein  28.79 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.69065  normal  0.921286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3523  extracellular solute-binding protein, family 3  30.14 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4249  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3302  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67840  putative ABC-type amino acid transporter  28.68 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5872  hypothetical protein  28.68 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1054  extracellular solute-binding protein family 3  29.68 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0164866  hitchhiker  0.000017747 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0967  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1916  extracellular solute-binding protein family 3  29.31 
 
 		 483 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3398  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1918  putative cache sensor protein  30.37 
 
 		 632 aa  98.6  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.149363  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3840  putative lipoprotein  28.16 
 
 		 255 aa  98.6  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0421756  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2937  hypothetical protein  27.6 
 
 		 257 aa  98.6  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0733  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.89 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.263143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4250  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.95 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3523  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 268 aa  92.8  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0746  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67850  putative ABC-type amino acid transport protein, periplasmic component  26.75 
 
 		 250 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.349677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0328  hypothetical protein  28.17 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3192  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0961443  hitchhiker  0.0000817621 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5333  hypothetical protein  26.58 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4251  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.05 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1143  hypothetical protein  27.6 
 
 		 255 aa  89.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0969  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 255 aa  89  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0687  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5873  hypothetical protein  26.75 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2978  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2990  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.604366  normal  0.133749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4891  hypothetical protein  25.67 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3860  hypothetical protein  26.03 
 
 		 265 aa  85.9  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0619  hypothetical protein  26.15 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566502  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3570  extracellular solute-binding protein family 3  28.89 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3761  extracellular solute-binding protein  35.77 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0772  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3638  extracellular solute-binding protein  35.77 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.055561  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2765  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67860  putative ABC-type amino acid transporter  27.16 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.339144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5874  hypothetical protein  26.64 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2624  hypothetical protein  26.51 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.547677 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1683  hypothetical protein  28.88 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0921  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2915  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.07 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3305  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0881  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3893  amino acid ABC transporter periplasmic protein  20.87 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1844  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000362453  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  23.65 
 
 		 736 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0702  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0691872 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18700  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  26.51 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.7204  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2829  extracellular solute-binding protein family 3  22.9 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479003 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1845  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00294253  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3134  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  28.83 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2573  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000612077  hitchhiker  0.000188073 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2071  extracellular solute-binding protein family 3  26.3 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.012684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1585  hypothetical protein  26.86 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  25.48 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  24.66 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  26.55 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  25.48 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  25.48 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1967  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.89 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0824  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1701  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.89 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  26.59 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  27.88 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  24.1 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1806  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  22.59 
 
 		 468 aa  53.9  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000163155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1910  amino acid ABC transporter periplasmic protein  19.48 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0380327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2962  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 287 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0123  hypothetical protein  27.1 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2740  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  20.41 
 
 		 1016 aa  53.5  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.12 
 
 		 503 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  22.79 
 
 		 490 aa  52.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  27.43 
 
 		 298 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  23.26 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 264 aa  52  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  26.2 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  25.54 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0661  extracellular solute-binding protein family 3  25.82 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.126579  hitchhiker  0.00355564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  24.68 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  26.2 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  22.57 
 
 		 714 aa  52  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>