More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2365 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2365  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 517 aa  998    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000394511  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3899  glucose-methanol-choline oxidoreductase  54.9 
 
 		 512 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306952  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0646  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.97 
 
 		 546 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4747  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.59 
 
 		 527 aa  372  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.42 
 
 		 536 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0530  choline dehydrogenase  36.33 
 
 		 570 aa  238  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37100  putative dehydrogenase  38.21 
 
 		 545 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  36.3 
 
 		 559 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.89 
 
 		 534 aa  236  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.83 
 
 		 509 aa  236  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  35.87 
 
 		 559 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0889  choline dehydrogenase  31.17 
 
 		 549 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1334  choline dehydrogenase  31.6 
 
 		 560 aa  233  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6326  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.4 
 
 		 554 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.33 
 
 		 549 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  32.17 
 
 		 550 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.27 
 
 		 543 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0776  choline dehydrogenase  30.98 
 
 		 549 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0802775 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4081  choline dehydrogenase  30.41 
 
 		 560 aa  229  9e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3840  choline dehydrogenase  32.03 
 
 		 561 aa  229  9e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1543  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.02 
 
 		 530 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3910  Choline dehydrogenase  36.98 
 
 		 531 aa  228  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.33 
 
 		 518 aa  228  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0562  choline dehydrogenase  31.84 
 
 		 549 aa  226  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4010  choline dehydrogenase  31.63 
 
 		 561 aa  226  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0405578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3020  choline dehydrogenase  34.42 
 
 		 553 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3226  choline dehydrogenase  33.33 
 
 		 556 aa  225  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000364  choline dehydrogenase  30.57 
 
 		 571 aa  224  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02642  choline dehydrogenase  30.98 
 
 		 552 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1946  choline dehydrogenase  30.52 
 
 		 560 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  31.89 
 
 		 561 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  31.89 
 
 		 561 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2072  choline dehydrogenase  30.39 
 
 		 562 aa  221  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  31.89 
 
 		 561 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  31.89 
 
 		 561 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2458  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.99 
 
 		 554 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.144677  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2161  choline dehydrogenase  35.71 
 
 		 588 aa  220  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.08 
 
 		 563 aa  220  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0279119  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3099  choline dehydrogenase  30.8 
 
 		 562 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3063  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.93 
 
 		 559 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.924929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1144  choline dehydrogenase  31.13 
 
 		 551 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2709  choline dehydrogenase  31.42 
 
 		 549 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1882  choline dehydrogenase  32.21 
 
 		 551 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2310  choline dehydrogenase  32.89 
 
 		 548 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.568209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06179  choline dehydrogenase  30.24 
 
 		 569 aa  217  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1624  choline dehydrogenase  32.29 
 
 		 558 aa  217  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529123  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3295  choline dehydrogenase  32.54 
 
 		 556 aa  217  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3312  choline dehydrogenase  32.54 
 
 		 556 aa  217  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0715  choline dehydrogenase  30.15 
 
 		 572 aa  217  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00120252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0370  choline dehydrogenase  32.04 
 
 		 556 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1005  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.28 
 
 		 503 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0326  choline dehydrogenase  32.04 
 
 		 556 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1022  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.28 
 
 		 476 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.980314  normal  0.873475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1032  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.28 
 
 		 476 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0392411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1639  choline dehydrogenase  32.42 
 
 		 558 aa  216  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.58518 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0373  choline dehydrogenase  31.97 
 
 		 562 aa  216  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.868243  normal  0.338212 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00267  choline dehydrogenase  32.54 
 
 		 556 aa  216  9e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0130  choline dehydrogenase  31.1 
 
 		 547 aa  216  9e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105235  normal  0.777409 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00270  hypothetical protein  32.54 
 
 		 556 aa  216  9e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3840  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.86 
 
 		 544 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0437  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.13 
 
 		 532 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253187  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0331  GMC oxidoreductase  33.95 
 
 		 557 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1196  choline dehydrogenase  31.11 
 
 		 565 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.18 
 
 		 515 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0908626  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0554  choline dehydrogenase  31.84 
 
 		 549 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0991  choline dehydrogenase  34.02 
 
 		 552 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0436021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  32.83 
 
 		 541 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1119  choline dehydrogenase  29.55 
 
 		 564 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4867  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.95 
 
 		 560 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4942  choline dehydrogenase  32.75 
 
 		 520 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.953244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2184  choline dehydrogenase  32.51 
 
 		 548 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.2 
 
 		 539 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0553  choline dehydrogenase  31.47 
 
 		 549 aa  213  7e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.93918  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2917  choline dehydrogenase  32.84 
 
 		 567 aa  213  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.80885  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2831  choline dehydrogenase  32.84 
 
 		 567 aa  213  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0856  choline dehydrogenase  32.51 
 
 		 548 aa  213  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1007  choline dehydrogenase  30.44 
 
 		 565 aa  212  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.21 
 
 		 542 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2822  choline dehydrogenase  33.15 
 
 		 551 aa  212  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1492  choline dehydrogenase  33.02 
 
 		 556 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1300  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.35 
 
 		 478 aa  210  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3854  choline dehydrogenase  33.95 
 
 		 546 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131347  hitchhiker  0.00687272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1582  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.46 
 
 		 533 aa  210  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3536  choline dehydrogenase  32.28 
 
 		 566 aa  210  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0342  choline dehydrogenase  32.1 
 
 		 562 aa  209  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3310  choline dehydrogenase  32.09 
 
 		 572 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1514  choline dehydrogenase  31.05 
 
 		 560 aa  209  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0264792  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5834  choline dehydrogenase  32.66 
 
 		 577 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  34.49 
 
 		 553 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10711  dehydrogenase  36.5 
 
 		 479 aa  207  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.439336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4076  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.72 
 
 		 516 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00359507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5064  choline dehydrogenase  32.6 
 
 		 565 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1710  choline dehydrogenase  32.28 
 
 		 561 aa  207  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  30.22 
 
 		 556 aa  207  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  34.2 
 
 		 534 aa  207  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2634  choline dehydrogenase  30.09 
 
 		 569 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2688  choline dehydrogenase  30.09 
 
 		 569 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5037  choline dehydrogenase  31.72 
 
 		 566 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2554  choline dehydrogenase  31.73 
 
 		 559 aa  206  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102453  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0553  choline dehydrogenase  32.09 
 
 		 566 aa  206  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>