More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0080 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 377 aa  785    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0532  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  43.34 
 
 		 378 aa  305  9.000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000712177  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  42.46 
 
 		 388 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  48.48 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  45.83 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  45.07 
 
 		 376 aa  286  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  41.01 
 
 		 375 aa  280  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  41.08 
 
 		 373 aa  276  6e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  45.61 
 
 		 296 aa  258  9e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  42.48 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  42.16 
 
 		 361 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  42.16 
 
 		 361 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  42.16 
 
 		 361 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  42.16 
 
 		 361 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  40.71 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  39.74 
 
 		 358 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  40.38 
 
 		 359 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  40.38 
 
 		 359 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  40.06 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  40.06 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  40.06 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  40.06 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  40.06 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  40.06 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  39.42 
 
 		 359 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3208  murein transglycosylase C  38.91 
 
 		 360 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  38.78 
 
 		 358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  38.78 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  38.78 
 
 		 358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  39.68 
 
 		 374 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  39.68 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  40 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  39.35 
 
 		 340 aa  223  3e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1669  murein transglycosylase C  38.46 
 
 		 363 aa  212  7e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  38.64 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  34.94 
 
 		 427 aa  191  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  36.52 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  32.14 
 
 		 385 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2724  lytic transglycosylase catalytic  44.79 
 
 		 519 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  32.14 
 
 		 429 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  33.46 
 
 		 413 aa  147  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  42.77 
 
 		 378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  43.45 
 
 		 359 aa  143  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  39.38 
 
 		 233 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  38.18 
 
 		 212 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  38.18 
 
 		 212 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  38.18 
 
 		 220 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  39.74 
 
 		 203 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  39.1 
 
 		 241 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  39.1 
 
 		 241 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  39.1 
 
 		 203 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  39.1 
 
 		 203 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  39.1 
 
 		 203 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  39.1 
 
 		 203 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  39.1 
 
 		 241 aa  115  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  39.1 
 
 		 203 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  38.69 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 203 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4233  lytic transglycosylase catalytic  37.82 
 
 		 215 aa  97.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  37.61 
 
 		 649 aa  69.3  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  37.61 
 
 		 649 aa  69.3  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  31.85 
 
 		 196 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  38.66 
 
 		 197 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 251 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  28.89 
 
 		 195 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  39.83 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  32.21 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  32.26 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  29.11 
 
 		 660 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  37.93 
 
 		 166 aa  66.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  35.4 
 
 		 661 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  30.67 
 
 		 647 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  36.45 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  34.82 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  34.38 
 
 		 798 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  34.48 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  34.82 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  33.93 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1059  lytic transglycosylase, catalytic  38.74 
 
 		 608 aa  63.2  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  37.96 
 
 		 650 aa  63.2  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  27.11 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  28.21 
 
 		 760 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2689  Lytic transglycosylase catalytic  32.48 
 
 		 752 aa  62.4  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  30.92 
 
 		 663 aa  62.4  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  28.21 
 
 		 757 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004396  transglycosylase Slt family  36.36 
 
 		 502 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  35.59 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  35.43 
 
 		 195 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  32.2 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  31.41 
 
 		 574 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  28.92 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  31.45 
 
 		 661 aa  61.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  30.82 
 
 		 721 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  25.29 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  35.54 
 
 		 661 aa  60.8  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  29.11 
 
 		 804 aa  60.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  28.48 
 
 		 774 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  28.48 
 
 		 774 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>