More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2128 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2128  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  396  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.544484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  80.95 
 
 		 197 aa  296  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  78.07 
 
 		 189 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2332  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376775  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  45.76 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  43.82 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 261 aa  52  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 252 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  31.25 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 237 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  39.22 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 234 aa  51.6  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 244 aa  51.2  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  40.52 
 
 		 209 aa  51.2  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0245  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.43 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.43 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  43.4 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.43 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.43 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.43 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.57 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  32.53 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.57 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.57 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.57 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>