More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2332 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2332  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 189 aa  374  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376775  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  45.36 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2128  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.544484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  45.25 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  40.54 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2423  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 237 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 217 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 217 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 242 aa  51.6  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 207 aa  51.2  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  36.99 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 235 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 233 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  38.71 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  33.82 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 223 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 227 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  42.47 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 232 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 241 aa  48.9  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 244 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 233 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 290 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  44.44 
 
 		 209 aa  48.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 202 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>