More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1217 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 457 aa  891    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  47.19 
 
 		 533 aa  360  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  46.5 
 
 		 533 aa  356  5e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  48.12 
 
 		 532 aa  352  8e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  46.7 
 
 		 530 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  44.19 
 
 		 399 aa  350  4e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  43.07 
 
 		 530 aa  350  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  47.85 
 
 		 532 aa  348  8e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  46.08 
 
 		 533 aa  346  6e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  45.45 
 
 		 525 aa  343  2.9999999999999997e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.73 
 
 		 856 aa  342  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  44.88 
 
 		 532 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  45.77 
 
 		 533 aa  339  7e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  44.15 
 
 		 531 aa  335  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  46.6 
 
 		 533 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  47.3 
 
 		 534 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  44.86 
 
 		 533 aa  333  4e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  45.11 
 
 		 532 aa  333  5e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  47.65 
 
 		 533 aa  333  6e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  46.9 
 
 		 533 aa  329  8e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  45.04 
 
 		 530 aa  328  9e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  43.06 
 
 		 416 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  47.62 
 
 		 533 aa  327  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  48.55 
 
 		 524 aa  325  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  45.69 
 
 		 526 aa  325  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  47.2 
 
 		 533 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  45.09 
 
 		 554 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  45.59 
 
 		 531 aa  324  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  42.86 
 
 		 473 aa  324  2e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  47.34 
 
 		 533 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  45.77 
 
 		 534 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.69 
 
 		 848 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  45.72 
 
 		 535 aa  323  5e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.89 
 
 		 849 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  42 
 
 		 554 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  44.15 
 
 		 594 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  44.15 
 
 		 594 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  44.33 
 
 		 532 aa  320  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  43.44 
 
 		 554 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  43.44 
 
 		 554 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  46.35 
 
 		 532 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.95 
 
 		 856 aa  316  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  43.38 
 
 		 535 aa  316  7e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  44.87 
 
 		 464 aa  315  7e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  43.47 
 
 		 759 aa  315  8e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  43.83 
 
 		 554 aa  312  9e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  41.61 
 
 		 403 aa  309  6.999999999999999e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  40.96 
 
 		 512 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  43.56 
 
 		 471 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  41.96 
 
 		 554 aa  306  5.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  42.45 
 
 		 556 aa  306  6e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  41.36 
 
 		 461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45.86 
 
 		 839 aa  302  7.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  43.69 
 
 		 534 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  42.17 
 
 		 533 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  42.42 
 
 		 470 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  42.42 
 
 		 470 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  40.86 
 
 		 406 aa  299  8e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  42.12 
 
 		 470 aa  297  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  40.47 
 
 		 632 aa  296  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  42.72 
 
 		 532 aa  296  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  42.72 
 
 		 532 aa  296  6e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  41.67 
 
 		 534 aa  296  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  41.97 
 
 		 740 aa  295  9e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  39.86 
 
 		 537 aa  295  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  43.61 
 
 		 534 aa  295  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  42.27 
 
 		 474 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.64 
 
 		 853 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  41.23 
 
 		 625 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  38.27 
 
 		 515 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  40.53 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  41.44 
 
 		 843 aa  290  4e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.94 
 
 		 834 aa  290  4e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  40.14 
 
 		 411 aa  288  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  41.29 
 
 		 632 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  41.29 
 
 		 632 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  42.22 
 
 		 531 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  40.22 
 
 		 423 aa  287  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  41.06 
 
 		 595 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  41.19 
 
 		 594 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  38.59 
 
 		 761 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.46 
 
 		 844 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  39.82 
 
 		 607 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  40.31 
 
 		 613 aa  282  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  41.22 
 
 		 510 aa  282  1e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.98 
 
 		 845 aa  281  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  40.75 
 
 		 613 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  40.31 
 
 		 613 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  41.77 
 
 		 640 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  41.19 
 
 		 636 aa  280  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  39.91 
 
 		 605 aa  279  7e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.73 
 
 		 844 aa  279  8e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  43.15 
 
 		 535 aa  278  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0627  protein-export membrane protein SecD  41.4 
 
 		 502 aa  278  2e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57035  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  38.97 
 
 		 619 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  39.63 
 
 		 503 aa  277  4e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  41.77 
 
 		 529 aa  276  4e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  41 
 
 		 521 aa  276  5e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.86 
 
 		 844 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  38.21 
 
 		 735 aa  276  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>