More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0705 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
268 aa  551  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  34.35 
 
 
539 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  37.55 
 
 
223 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  33.48 
 
 
536 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  37.39 
 
 
553 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  32.54 
 
 
257 aa  143  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  33.09 
 
 
261 aa  143  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.03 
 
 
629 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  32.47 
 
 
624 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.18 
 
 
632 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.64 
 
 
621 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  36.48 
 
 
300 aa  142  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  29.96 
 
 
605 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  35.65 
 
 
542 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  34.5 
 
 
548 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.02 
 
 
614 aa  139  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  32.19 
 
 
528 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.13 
 
 
609 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  32.17 
 
 
609 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.9 
 
 
531 aa  136  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  34.51 
 
 
534 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.19 
 
 
600 aa  136  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  35.11 
 
 
209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  32.47 
 
 
617 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.09 
 
 
550 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28520  preprotein translocase subunit YidC  32.31 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000336467  hitchhiker  0.00141204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.32 
 
 
616 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  36.12 
 
 
534 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  36.1 
 
 
345 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  34.92 
 
 
229 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  36.05 
 
 
219 aa  132  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  36.44 
 
 
217 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  32.47 
 
 
604 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  32.03 
 
 
614 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.96 
 
 
532 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.48 
 
 
577 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.36 
 
 
517 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  30.04 
 
 
556 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.13 
 
 
607 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  34.04 
 
 
330 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  32.76 
 
 
600 aa  129  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.74 
 
 
597 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  32.3 
 
 
592 aa  129  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.71 
 
 
584 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  31.33 
 
 
616 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.9 
 
 
622 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  31.33 
 
 
616 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.25 
 
 
518 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  30 
 
 
530 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.8 
 
 
532 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0095  60 kDa inner membrane insertion protein  36.93 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.08 
 
 
609 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  34.65 
 
 
542 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.82 
 
 
595 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.6 
 
 
597 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.91 
 
 
541 aa  125  7e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.28 
 
 
536 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.6 
 
 
530 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  49.58 
 
 
213 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.6 
 
 
597 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.47 
 
 
610 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.47 
 
 
610 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4959  60 kDa inner membrane insertion protein  35.32 
 
 
231 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000507669  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.62 
 
 
620 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.4 
 
 
626 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  30.6 
 
 
536 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  30.97 
 
 
537 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  28.88 
 
 
541 aa  122  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.73 
 
 
608 aa  122  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.43 
 
 
528 aa  122  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  30.08 
 
 
541 aa  122  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  32 
 
 
225 aa  121  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.47 
 
 
544 aa  121  9.999999999999999e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  35.65 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.03 
 
 
623 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.03 
 
 
623 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.18 
 
 
628 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.74 
 
 
630 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  30.9 
 
 
530 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  32.02 
 
 
589 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  27.76 
 
 
308 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  32.44 
 
 
255 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  32.44 
 
 
255 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  32.44 
 
 
255 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  32.44 
 
 
255 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  32.44 
 
 
255 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  32.44 
 
 
255 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  29.15 
 
 
544 aa  118  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  29.96 
 
 
536 aa  118  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.19 
 
 
384 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  31.67 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.74 
 
 
579 aa  117  9.999999999999999e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.3 
 
 
579 aa  118  9.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.64 
 
 
575 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.4 
 
 
635 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  31.44 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  30.13 
 
 
542 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  36.21 
 
 
462 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.87 
 
 
621 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>