More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0088 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0088  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 262 aa  541  1e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  35.66 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  33.85 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  41.76 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  33.08 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  33.08 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  33.08 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  40.66 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  35.38 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  35.38 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  33.57 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  40.66 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  35.16 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  36.19 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  42.39 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  40.86 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0187  lytic transglycosylase, catalytic  42.22 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0753643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  36.08 
 
 		 603 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  40.45 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  40.22 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  29 
 
 		 833 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  35.79 
 
 		 182 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  41.57 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  33.64 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  39.56 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  41.57 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  39.33 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  31.54 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  41.46 
 
 		 438 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  39.17 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  31.48 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  37.36 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  34.68 
 
 		 777 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  40.22 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1033  Lytic transglycosylase catalytic  32 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  33.88 
 
 		 194 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  32.77 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  40.7 
 
 		 800 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  37.78 
 
 		 233 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  30.67 
 
 		 311 aa  53.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  34.09 
 
 		 120 aa  52.8  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  36 
 
 		 217 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  36.26 
 
 		 191 aa  52.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  35.87 
 
 		 204 aa  52.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  36.52 
 
 		 199 aa  52.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  36.17 
 
 		 358 aa  52.4  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  36.17 
 
 		 358 aa  52.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  36.17 
 
 		 362 aa  52.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  35.79 
 
 		 218 aa  52.4  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  33.03 
 
 		 442 aa  52.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  36.96 
 
 		 204 aa  52.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 206 aa  52.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  27.69 
 
 		 359 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  35.64 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  32.5 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  35.96 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  39.29 
 
 		 152 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  41.89 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  35.16 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  36.9 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  35.34 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  36.04 
 
 		 355 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  39.33 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  32.22 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  33.7 
 
 		 202 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  27.91 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  37.08 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  36.96 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  33.9 
 
 		 295 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  25.76 
 
 		 175 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  34.34 
 
 		 154 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  36.96 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  33.7 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  35.48 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  38.2 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  32.97 
 
 		 190 aa  50.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  38.04 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  36.11 
 
 		 372 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  32.08 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6203  Lytic transglycosylase catalytic  30.83 
 
 		 384 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0827287  normal  0.0199903 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  36.04 
 
 		 354 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  33.94 
 
 		 393 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 212 aa  49.7  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  34.62 
 
 		 306 aa  49.7  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  30.28 
 
 		 445 aa  49.7  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  36.11 
 
 		 372 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  35.16 
 
 		 310 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  28.65 
 
 		 190 aa  49.3  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  29.09 
 
 		 414 aa  49.3  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  35.45 
 
 		 398 aa  49.3  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>