219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1033 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1033  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 237 aa  480  1e-135  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3187  cell invasion protein  39.56 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.927975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2999  invasion protein IagB  39.56 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000303944  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3066  invasion protein IagB  39.56 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.490533 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3082  cell invasion protein  39.56 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.58 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3030  invasion protein IagB  38.46 
 
 		 160 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0325324 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1265  lytic transglycosylase catalytic  37.07 
 
 		 407 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.254605 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  36.28 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2156  BapC protein  35.42 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1239  lytic transglycosylase, catalytic  36.21 
 
 		 404 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2068  BapC protein  35.42 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0527025  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1524  BapC protein  35.42 
 
 		 187 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0565  BapC protein  35.42 
 
 		 187 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146526  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0632  Lytic transglycosylase catalytic  42.27 
 
 		 175 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  33.6 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 		 175 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2079  BapC protein  35.42 
 
 		 187 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.22209  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0760  BapC protein  35.42 
 
 		 187 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.832936  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4498  lytic transglycosylase, catalytic  36.21 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1337  lytic transglycosylase catalytic  36.21 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545884  normal  0.0328335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1938  lytic transglycosylase catalytic  37.07 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0154763 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0847  BapC protein  35.42 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1355  lytic transglycosylase, catalytic  36.21 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0669029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0379  invasion protein  34.38 
 
 		 146 aa  62  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0873  lytic transglycosylase, catalytic  36.21 
 
 		 599 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2644  lytic transglycosylase, catalytic  37.14 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1431  lytic transglycosylase, catalytic  34 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  37.5 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000012846 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0163  lytic transglycosylase, catalytic  37.96 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0042056  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  34.55 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2311  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5439  Lytic transglycosylase catalytic  32.99 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0168  protein IpgF  31.78 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00546577  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5033  Lytic transglycosylase catalytic  32.99 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0964  Lytic transglycosylase catalytic  34.38 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  41.28 
 
 		 375 aa  55.5  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7409  Lytic transglycosylase catalytic  37.25 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  34.78 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6296  lytic transglycosylase, catalytic  34.65 
 
 		 140 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  37.93 
 
 		 372 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0088  Lytic transglycosylase catalytic  32 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6566  lytic transglycosylase catalytic  28.57 
 
 		 140 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  38.79 
 
 		 376 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  27.36 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  38.89 
 
 		 361 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  38.89 
 
 		 361 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  25.74 
 
 		 304 aa  53.1  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  38.89 
 
 		 361 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5017  Lytic transglycosylase catalytic  34.02 
 
 		 183 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.260237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  38.89 
 
 		 361 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  29.29 
 
 		 190 aa  52.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5422  Lytic transglycosylase catalytic  34.02 
 
 		 183 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2099  lytic transglycosylase, catalytic  33.06 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  27.63 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  38.89 
 
 		 361 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5550  lytic transglycosylase catalytic  32.32 
 
 		 141 aa  52  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0239978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 		 261 aa  52  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  34.95 
 
 		 228 aa  52  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0111  lytic transglycosylase PilT  34.15 
 
 		 186 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  30.89 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  30.89 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  30.89 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  41.46 
 
 		 374 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  30.89 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2657  lytic transglycosylase, catalytic  24.89 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00887082  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  41.46 
 
 		 374 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  39.84 
 
 		 373 aa  51.6  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  31.13 
 
 		 360 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  34.4 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  29.1 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  36.19 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  42.68 
 
 		 360 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  35.42 
 
 		 174 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  29.32 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  41.46 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1531  Lytic transglycosylase catalytic  32.35 
 
 		 158 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5196  Lytic transglycosylase catalytic  32.35 
 
 		 158 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  28.57 
 
 		 645 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  24.39 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  30.89 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  39.02 
 
 		 359 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  32.86 
 
 		 296 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  30.08 
 
 		 261 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  31.71 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  30.89 
 
 		 261 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  30.46 
 
 		 359 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  31.15 
 
 		 261 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  30.46 
 
 		 360 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  30.46 
 
 		 359 aa  49.3  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  30.46 
 
 		 359 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  30.46 
 
 		 359 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  30.46 
 
 		 359 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  30.46 
 
 		 359 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  30.61 
 
 		 438 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>