More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6203 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6203  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 384 aa  770    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0827287  normal  0.0199903 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4448  lytic transglycosylase, catalytic  41.73 
 
 		 250 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6408  lytic transglycosylase catalytic  42.4 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  46.9 
 
 		 233 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4565  lytic transglycosylase catalytic  43.31 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0155983  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9824  type IV system transglycosylase  37.84 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  43.9 
 
 		 203 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  41.94 
 
 		 204 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  41.22 
 
 		 202 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  32.32 
 
 		 216 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  39.68 
 
 		 442 aa  94.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  33.13 
 
 		 191 aa  94  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  46.36 
 
 		 218 aa  92.8  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  44.17 
 
 		 251 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  38.1 
 
 		 204 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  38.3 
 
 		 260 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  39.47 
 
 		 211 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 280 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 		 204 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  39.84 
 
 		 212 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  45.22 
 
 		 258 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4180  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 210 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  37.01 
 
 		 198 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  36.59 
 
 		 206 aa  90.9  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  38.26 
 
 		 263 aa  90.1  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  40.68 
 
 		 242 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 196 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  40.98 
 
 		 261 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 217 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 260 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  43.64 
 
 		 282 aa  87.4  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  37.4 
 
 		 189 aa  87  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  42.74 
 
 		 297 aa  86.7  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 		 297 aa  86.7  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 207 aa  86.3  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  43.24 
 
 		 196 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  40.16 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  39.02 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  37.3 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  45.45 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  36.96 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  38.98 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  43.09 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.45 
 
 		 214 aa  82  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  36.88 
 
 		 198 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  38.52 
 
 		 199 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  35.23 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  44.04 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  39.34 
 
 		 271 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  26.87 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  35.23 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0483  lytic transglycosylase, catalytic  37.24 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  37.12 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  42.4 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  35.2 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  36.72 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  36.72 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.54 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1002  lytic transglycosylase, catalytic  42.59 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578014  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  34.78 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  41.96 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  37.5 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  38.68 
 
 		 438 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  38.14 
 
 		 200 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  37.4 
 
 		 244 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  41.28 
 
 		 197 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0307  lytic transglycosylase, catalytic  37.04 
 
 		 332 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  43.12 
 
 		 194 aa  79  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  40.37 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  44 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  32.43 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  34.86 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  36.52 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  37.32 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  34.15 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  38.14 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  35.95 
 
 		 637 aa  77  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  35.54 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  40.68 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  41.38 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  37.61 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  34.96 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  34.46 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  36.75 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  34.46 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  37.42 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  36.75 
 
 		 251 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  36.75 
 
 		 251 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  35.29 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  37.6 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3765  lytic transglycosylase, catalytic  29.33 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 146 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  36.67 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.54 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  35.97 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  35.34 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  35.17 
 
 		 698 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>