More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0859 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  957    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  58.87 
 
 		 470 aa  561  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  59.74 
 
 		 457 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  58.44 
 
 		 457 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  56.93 
 
 		 458 aa  542  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  58.82 
 
 		 464 aa  536  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  55.6 
 
 		 461 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  53.48 
 
 		 462 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  53.38 
 
 		 463 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  52.71 
 
 		 469 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  51.5 
 
 		 471 aa  496  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  51.3 
 
 		 462 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  51.5 
 
 		 471 aa  496  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  51.42 
 
 		 462 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  52.48 
 
 		 462 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  52.74 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  51.96 
 
 		 471 aa  481  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  53 
 
 		 488 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  51.63 
 
 		 470 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  50.54 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  49.89 
 
 		 468 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  50.22 
 
 		 468 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  50 
 
 		 467 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  49.35 
 
 		 484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  48.81 
 
 		 468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  50.11 
 
 		 460 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  49.78 
 
 		 461 aa  441  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  49.78 
 
 		 460 aa  444  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  49.24 
 
 		 460 aa  445  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  48.81 
 
 		 468 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  48.92 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  48.16 
 
 		 468 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  49.46 
 
 		 468 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  49.13 
 
 		 461 aa  431  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  49.13 
 
 		 461 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  48.58 
 
 		 468 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  50 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  46.44 
 
 		 468 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  44.37 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  43.46 
 
 		 456 aa  354  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  41.69 
 
 		 455 aa  331  1e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  42.43 
 
 		 456 aa  330  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  41.85 
 
 		 452 aa  330  4e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  41.1 
 
 		 462 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  41.84 
 
 		 453 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  40.77 
 
 		 440 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  39.06 
 
 		 463 aa  317  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  40.7 
 
 		 460 aa  315  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  39.82 
 
 		 456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  39.59 
 
 		 475 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  37.63 
 
 		 458 aa  310  2.9999999999999997e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  41.63 
 
 		 456 aa  310  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  39.56 
 
 		 463 aa  306  6e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  40 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  40.45 
 
 		 459 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  41.97 
 
 		 485 aa  301  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  37.92 
 
 		 465 aa  300  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  39.73 
 
 		 458 aa  297  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  38.58 
 
 		 460 aa  292  7e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  38.51 
 
 		 455 aa  291  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  39.03 
 
 		 459 aa  289  8e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  41.01 
 
 		 465 aa  289  8e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  37.78 
 
 		 451 aa  286  4e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  38.24 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  37.36 
 
 		 469 aa  281  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  37.15 
 
 		 467 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  38.34 
 
 		 464 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  37.09 
 
 		 472 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  38.51 
 
 		 481 aa  266  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  36.9 
 
 		 457 aa  263  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  36.21 
 
 		 474 aa  260  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  37.05 
 
 		 479 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  36.67 
 
 		 456 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  31.97 
 
 		 452 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  33.11 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  33.41 
 
 		 459 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  30.44 
 
 		 476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  32.35 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  32.35 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  31.45 
 
 		 484 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  33.47 
 
 		 496 aa  194  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  31.92 
 
 		 465 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  31.29 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  30.52 
 
 		 448 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  31.99 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78234  Glutamate carboxypeptidase-like protein  28.94 
 
 		 481 aa  186  7e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  31.96 
 
 		 445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  27.86 
 
 		 512 aa  183  7e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  30.64 
 
 		 448 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  29.81 
 
 		 453 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30.44 
 
 		 488 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  28.08 
 
 		 535 aa  180  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  32.44 
 
 		 456 aa  179  7e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  29.07 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  35.13 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  30.88 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  30.53 
 
 		 476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  30.46 
 
 		 472 aa  173  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  31.03 
 
 		 453 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  31.03 
 
 		 453 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>