More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2020 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 428 aa  852    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  66.59 
 
 		 432 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  58.28 
 
 		 441 aa  499  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  58.33 
 
 		 439 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  61.88 
 
 		 426 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  54.8 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  51.38 
 
 		 439 aa  442  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  56.5 
 
 		 468 aa  444  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  50.31 
 
 		 476 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  58.12 
 
 		 438 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  52.75 
 
 		 438 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  49.09 
 
 		 446 aa  428  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  52.75 
 
 		 438 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  52.74 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  50.57 
 
 		 445 aa  428  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  50.57 
 
 		 445 aa  428  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  50.8 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  55.45 
 
 		 439 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  57.96 
 
 		 483 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  52.68 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  49.67 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  54.77 
 
 		 437 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  54.27 
 
 		 481 aa  423  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  54.14 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  53.63 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  50.68 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  48.83 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  53.25 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  54.09 
 
 		 415 aa  411  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  49.77 
 
 		 443 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  48.74 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  54.78 
 
 		 482 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  54.78 
 
 		 482 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  48.02 
 
 		 444 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  50.12 
 
 		 452 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  45.88 
 
 		 455 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  44.05 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  44.95 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  50.23 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  43.62 
 
 		 478 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  43.62 
 
 		 478 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  44.59 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  49.62 
 
 		 444 aa  378  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  48.5 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  44.37 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  47.37 
 
 		 444 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  46.06 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  42.42 
 
 		 479 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  45.93 
 
 		 461 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  49.48 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  50.38 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  49.48 
 
 		 424 aa  368  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  56.92 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  47.18 
 
 		 445 aa  371  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  43.79 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  50.13 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  48.97 
 
 		 442 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  46.77 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  41.28 
 
 		 480 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  46.59 
 
 		 457 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  45.41 
 
 		 456 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  49.36 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  45.52 
 
 		 471 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  47.37 
 
 		 422 aa  364  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  45.58 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  46.95 
 
 		 440 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  43.2 
 
 		 479 aa  363  4e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  47.43 
 
 		 444 aa  363  4e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  46.71 
 
 		 440 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  48.93 
 
 		 515 aa  360  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  47.93 
 
 		 535 aa  360  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  48.18 
 
 		 445 aa  360  4e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  44.78 
 
 		 447 aa  359  4e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  47.14 
 
 		 550 aa  358  7e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  45.41 
 
 		 445 aa  358  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  44.24 
 
 		 444 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  47.14 
 
 		 538 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  49.1 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  48.4 
 
 		 515 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  48.4 
 
 		 515 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  48.4 
 
 		 515 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  47 
 
 		 449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  48.4 
 
 		 513 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  47.86 
 
 		 515 aa  356  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  45.96 
 
 		 448 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  45.96 
 
 		 448 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  48.13 
 
 		 511 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  47 
 
 		 477 aa  354  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  46.49 
 
 		 530 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  54.27 
 
 		 453 aa  355  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  47.53 
 
 		 532 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  41.89 
 
 		 490 aa  354  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  47.82 
 
 		 440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  46.23 
 
 		 549 aa  353  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  47.14 
 
 		 477 aa  353  4e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  45.48 
 
 		 434 aa  352  7e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  45.31 
 
 		 440 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  47.34 
 
 		 444 aa  350  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  42.55 
 
 		 530 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  42.55 
 
 		 524 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>