145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11191 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  71.96 
 
 		 624 aa  858    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  71.96 
 
 		 624 aa  858    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  72.19 
 
 		 608 aa  801    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  71.96 
 
 		 624 aa  858    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  73.41 
 
 		 599 aa  855    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  100 
 
 		 635 aa  1256    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  40.26 
 
 		 614 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  37.37 
 
 		 622 aa  363  7.0000000000000005e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  35.62 
 
 		 566 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.95 
 
 		 622 aa  304  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  29.49 
 
 		 603 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  35.62 
 
 		 570 aa  121  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 		 566 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.81 
 
 		 567 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  25.99 
 
 		 568 aa  102  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 		 567 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.79 
 
 		 578 aa  94.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 563 aa  94.7  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  30.13 
 
 		 576 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  34.66 
 
 		 597 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  41.09 
 
 		 581 aa  90.5  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.89 
 
 		 579 aa  82  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  23.39 
 
 		 551 aa  78.2  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  28.29 
 
 		 591 aa  77.4  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 580 aa  77  0.0000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 558 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  24.79 
 
 		 604 aa  74.3  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  23.08 
 
 		 606 aa  73.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  26.72 
 
 		 565 aa  72  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 569 aa  70.5  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  30.64 
 
 		 555 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  30.64 
 
 		 555 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 554 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 550 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  23.43 
 
 		 590 aa  67  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  25 
 
 		 585 aa  66.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2945  extracellular solute-binding protein family 5  22.37 
 
 		 565 aa  62  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472455  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  26.46 
 
 		 622 aa  58.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  25.32 
 
 		 534 aa  56.2  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  21.82 
 
 		 586 aa  55.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  25.9 
 
 		 587 aa  55.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  23.23 
 
 		 631 aa  54.7  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2585  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 548 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 548 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 537 aa  54.3  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0148  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  20.79 
 
 		 551 aa  53.5  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000587403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.19 
 
 		 538 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  21.25 
 
 		 559 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  24.43 
 
 		 554 aa  53.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  21.92 
 
 		 532 aa  52.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.09 
 
 		 592 aa  51.6  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  21.41 
 
 		 600 aa  52  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  23.61 
 
 		 627 aa  51.6  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  23.54 
 
 		 510 aa  51.2  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3826  extracellular solute-binding protein family 5  20.16 
 
 		 610 aa  51.2  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497538 
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.84 
 
 		 622 aa  51.2  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 545 aa  51.2  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 621 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3638  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 592 aa  50.8  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  31.37 
 
 		 619 aa  50.8  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  22.73 
 
 		 581 aa  50.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  21.3 
 
 		 589 aa  50.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  23.74 
 
 		 518 aa  50.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.86 
 
 		 610 aa  50.4  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2114  extracellular solute-binding protein family 5  25.97 
 
 		 538 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.59472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  26.4 
 
 		 555 aa  50.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2713  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 608 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  24.1 
 
 		 557 aa  50.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  25.42 
 
 		 619 aa  50.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 		 526 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3349  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 		 559 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109598  normal  0.0359992 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0390  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  24.18 
 
 		 545 aa  49.3  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0784015  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 565 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 549 aa  49.7  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  20.81 
 
 		 622 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 556 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  21.83 
 
 		 606 aa  49.7  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  21.8 
 
 		 526 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 		 522 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.4 
 
 		 532 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0979  ABC transporter, substrate-binding protein  19.15 
 
 		 553 aa  48.9  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  20.36 
 
 		 541 aa  48.5  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0536  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  23.53 
 
 		 549 aa  48.9  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1602  extracellular solute-binding protein family 5  24.28 
 
 		 534 aa  48.9  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  25.27 
 
 		 593 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2902  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 622 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19921  normal  0.272453 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 544 aa  48.5  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0139  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 		 627 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  27.87 
 
 		 525 aa  47.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 591 aa  47.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 544 aa  47.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  29.06 
 
 		 581 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  24.65 
 
 		 587 aa  47.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  24.02 
 
 		 538 aa  47.4  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  23.39 
 
 		 543 aa  47.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  23.39 
 
 		 543 aa  47.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  23.39 
 
 		 543 aa  47.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  23.39 
 
 		 543 aa  47.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  24.27 
 
 		 629 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>