229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0936 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0936  phage integrase family protein  100 
 
 		 168 aa  350  5.9999999999999994e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0566684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0563  phage integrase family protein  38.13 
 
 		 191 aa  97.8  7e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00000738062  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0945  phage integrase family protein  38.13 
 
 		 211 aa  97.8  7e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.237394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4647  integrase family protein  40.34 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1283  phage integrase family protein  29.33 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000135681  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  28.12 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  28.68 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  30.77 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  28.48 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  27.91 
 
 		 397 aa  55.1  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4273  integrase family protein  34.82 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.42005  normal  0.068032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2107  integrase family protein  34.82 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.26894 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  33.85 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  30.47 
 
 		 385 aa  54.7  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  28.48 
 
 		 328 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  28.48 
 
 		 328 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  28.3 
 
 		 292 aa  53.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  29.77 
 
 		 289 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  34.21 
 
 		 302 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  30.97 
 
 		 303 aa  53.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 298 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  31.06 
 
 		 396 aa  52.4  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1134  tyrosine recombinase XerD  34.57 
 
 		 308 aa  52  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  27.61 
 
 		 311 aa  52  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  35.58 
 
 		 207 aa  52  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  31.25 
 
 		 365 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  26.83 
 
 		 319 aa  51.6  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  28.93 
 
 		 317 aa  51.6  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  31.01 
 
 		 188 aa  51.2  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2172  tyrosine recombinase XerD  32.1 
 
 		 309 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.178894 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  35.44 
 
 		 301 aa  51.2  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 190 aa  50.8  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  28.57 
 
 		 283 aa  50.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  26.77 
 
 		 296 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  30.89 
 
 		 393 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0907  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.53 
 
 		 307 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  30.6 
 
 		 310 aa  49.3  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  27.91 
 
 		 308 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  28.79 
 
 		 291 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  29.63 
 
 		 364 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  26.77 
 
 		 296 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0677  integrase family protein  32.61 
 
 		 291 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.92563 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  30 
 
 		 311 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  30.88 
 
 		 291 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  30.88 
 
 		 290 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  26.52 
 
 		 310 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.57 
 
 		 308 aa  49.3  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1075  integrase family protein  27.69 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2770  integrase family protein  29.92 
 
 		 434 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00484712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  31.36 
 
 		 295 aa  48.5  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1847  integrase family protein  30.08 
 
 		 314 aa  48.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  31.82 
 
 		 295 aa  48.5  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  30.36 
 
 		 299 aa  47.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  28.81 
 
 		 304 aa  47.8  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  25.6 
 
 		 325 aa  47.8  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  29.66 
 
 		 312 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  33.33 
 
 		 292 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  23.26 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  29.82 
 
 		 295 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  26.36 
 
 		 411 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  27.46 
 
 		 292 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  29.46 
 
 		 311 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  31.36 
 
 		 313 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0872  integrase family protein  28.83 
 
 		 316 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  29.46 
 
 		 311 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  29.79 
 
 		 333 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  30.23 
 
 		 327 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0533  tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 		 347 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  34.52 
 
 		 304 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  28.91 
 
 		 354 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  27.82 
 
 		 292 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  27.82 
 
 		 292 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  27.82 
 
 		 292 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.63 
 
 		 306 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  29.63 
 
 		 296 aa  45.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  31.63 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  29.91 
 
 		 309 aa  45.8  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  23.26 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  31.4 
 
 		 334 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  31.78 
 
 		 290 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1228  hypothetical protein  33.06 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7575  tyrosine recombinase XerD subunit  31.52 
 
 		 308 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  24.75 
 
 		 256 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  29.2 
 
 		 353 aa  45.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0393  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 319 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543195  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  29.55 
 
 		 291 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  29.25 
 
 		 309 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  28.42 
 
 		 334 aa  45.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  29.73 
 
 		 301 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  32.47 
 
 		 319 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  35.06 
 
 		 295 aa  45.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1468  phage integrase family protein  29.63 
 
 		 304 aa  45.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0296  tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 		 351 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1953  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.43 
 
 		 307 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2031  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.43 
 
 		 307 aa  44.7  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  30.23 
 
 		 330 aa  44.7  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  30.41 
 
 		 332 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  35.21 
 
 		 306 aa  44.7  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  29.35 
 
 		 320 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  30.08 
 
 		 321 aa  44.7  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>