More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3829 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 940 aa  1946    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  35.85 
 
 		 984 aa  568  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  35.85 
 
 		 984 aa  568  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  36.17 
 
 		 980 aa  521  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  32.45 
 
 		 973 aa  512  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  34.68 
 
 		 983 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 		 962 aa  508  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 		 938 aa  485  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  30.31 
 
 		 968 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  33.41 
 
 		 964 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 		 961 aa  466  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 		 980 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  32.32 
 
 		 796 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  36.38 
 
 		 840 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  30.96 
 
 		 711 aa  369  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  43.08 
 
 		 1004 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  48.09 
 
 		 1061 aa  361  3e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  46.38 
 
 		 1055 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  45 
 
 		 1060 aa  353  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  47.04 
 
 		 1056 aa  353  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  45.2 
 
 		 1067 aa  351  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  43.56 
 
 		 1054 aa  346  1e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  42.99 
 
 		 1065 aa  345  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  43.88 
 
 		 1102 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  42.35 
 
 		 1065 aa  340  9e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  43 
 
 		 1073 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  45.19 
 
 		 1048 aa  337  7e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  40.41 
 
 		 746 aa  281  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  36.63 
 
 		 540 aa  266  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  40.37 
 
 		 528 aa  265  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  50.2 
 
 		 270 aa  260  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  39.49 
 
 		 524 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  34.79 
 
 		 542 aa  234  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  40.78 
 
 		 840 aa  219  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  34.92 
 
 		 796 aa  208  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  30.7 
 
 		 568 aa  204  8e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  31.17 
 
 		 515 aa  193  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  32.05 
 
 		 539 aa  163  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 		 691 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  29.62 
 
 		 544 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  43.29 
 
 		 576 aa  148  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  26.22 
 
 		 686 aa  140  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  42.03 
 
 		 560 aa  120  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  53.26 
 
 		 102 aa  103  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  45.69 
 
 		 636 aa  100  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  40.14 
 
 		 269 aa  92  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  40 
 
 		 760 aa  89.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  40.15 
 
 		 654 aa  89.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  44.17 
 
 		 518 aa  89  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  43.97 
 
 		 268 aa  88.6  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 635 aa  88.2  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  23.5 
 
 		 724 aa  88.2  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.27 
 
 		 491 aa  87.8  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  40.17 
 
 		 1171 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 424 aa  87  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  54.88 
 
 		 499 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3523  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.53 
 
 		 363 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3509  metal-dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 351 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  36.72 
 
 		 422 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0538  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 363 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.38 
 
 		 345 aa  83.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0974  metal dependent phosphohydrolase  41.61 
 
 		 160 aa  83.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00455004  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3816  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 351 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0960158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0908  metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00247185  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2085  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.012958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0663  response regulator receiver  53.85 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.38 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  47.17 
 
 		 648 aa  81.3  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  38.06 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 419 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  38.46 
 
 		 649 aa  80.5  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0148  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.92 
 
 		 385 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0737  metal dependent phosphohydrolase  43.48 
 
 		 254 aa  80.1  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  37.61 
 
 		 545 aa  79.7  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40.3 
 
 		 1073 aa  79.7  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  36.52 
 
 		 647 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0479  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.86 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5034  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.39 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749308  hitchhiker  0.00297277 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  39.17 
 
 		 710 aa  79  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.24 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  42.11 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0061  metal dependent phosphohydrolase  38.93 
 
 		 465 aa  78.2  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3076  metal dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  55.41 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5340  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.39 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0886  metal dependent phosphohydrolase  37.82 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00322853  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1406  response regulator  37.5 
 
 		 351 aa  77.4  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0007  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 379 aa  77.4  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.829613  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  59.32 
 
 		 461 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 		 389 aa  77  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 		 417 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.52 
 
 		 367 aa  77.4  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  59.32 
 
 		 461 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1421  putative PAS/PAC sensor protein  50.62 
 
 		 535 aa  76.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0232449  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  54.05 
 
 		 428 aa  77  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  43.16 
 
 		 353 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 		 444 aa  76.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>