More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3433 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  394  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  55.21 
 
 		 203 aa  228  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2964  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 195 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0240167  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  56.77 
 
 		 196 aa  225  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  57.29 
 
 		 196 aa  224  9e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1418  TetR family transcriptional regulator  55.44 
 
 		 196 aa  224  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1379  TetR family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 196 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 203 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 203 aa  217  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 203 aa  216  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1089  TetR family transcriptional regulator  47.94 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  43.78 
 
 		 198 aa  157  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000004  transcriptional regulator  42.16 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05594  transcriptional regulator  41.08 
 
 		 191 aa  148  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 192 aa  124  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 193 aa  98.2  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 204 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 194 aa  87.8  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 213 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 213 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 371 aa  85.5  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 222 aa  84.7  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1395  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0418723  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0969  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5750  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0412881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2619  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.362845  normal  0.246457 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1478  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1106  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3137  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7468  transcriptional regulator, TetR family  50.72 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3573  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0355911  normal  0.084172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12083  transcriptional regulator, TetR family protein  30.81 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.43 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  32 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
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NC_009664  Krad_0375  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00856394  normal  0.419772 
 
 
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NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  31.43 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 210 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 236 aa  74.3  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 198 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
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NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 236 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
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NC_009620  Smed_3676  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  decreased coverage  0.00105541 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
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