94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3098 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  82.58 
 
 		 131 aa  225  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  75 
 
 		 131 aa  207  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  77.78 
 
 		 129 aa  206  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  66.67 
 
 		 131 aa  191  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  70.45 
 
 		 128 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  70.45 
 
 		 128 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  69.7 
 
 		 128 aa  191  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  68.94 
 
 		 128 aa  190  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  68.94 
 
 		 128 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  68.94 
 
 		 128 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  68.94 
 
 		 128 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  68.94 
 
 		 128 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  68.94 
 
 		 128 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  68.94 
 
 		 131 aa  184  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  67.42 
 
 		 131 aa  167  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  40.41 
 
 		 148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  37.41 
 
 		 153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3770  phage shock protein C  41.38 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.289973  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01874  hypothetical protein  38.89 
 
 		 129 aa  104  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003812  phage shock protein C  36.51 
 
 		 129 aa  98.6  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1281  phage shock protein C  37.12 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  33.07 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  35.2 
 
 		 136 aa  86.7  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  34.09 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2608  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.88 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2319  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.65 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.033719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1421  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.65 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1516  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.65 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1816  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.65 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1948  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.65 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1542  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.65 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2340  phage shock protein C, PspC  34.65 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00136748  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01294  hypothetical protein  34.65 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01283  DNA-binding transcriptional activator  34.65 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2333  DNA-binding transcriptional activator PspC  33.33 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1812  DNA-binding transcriptional activator PspC  33.33 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000743707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1874  DNA-binding transcriptional activator PspC  33.33 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1813  DNA-binding transcriptional activator PspC  33.33 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1462  DNA-binding transcriptional activator PspC  33.33 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.269828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1644  DNA-binding transcriptional activator PspC  33.33 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000607871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2167  DNA-binding transcriptional activator PspC  35.94 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3224  phage shock protein C, PspC  33.07 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1724  DNA-binding transcriptional activator PspC  32.26 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367196  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1801  phage shock protein C, PspC  33.06 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.830677 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.92 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1788  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.13 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2535  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.13 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1896  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.13 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0209  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.841692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  27.78 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1223  phage shock protein C, PspC  30.4 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  32.63 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1158  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0386  phage shock protein C, PspC  30.95 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.656365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2939  phage shock protein C, PspC  30.77 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  32.58 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2495  phage shock protein C, PspC  59.18 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0137298  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  45.28 
 
 		 346 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  37.7 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  37.7 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  37.31 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  39.34 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  46 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  30.38 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  40.98 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 418 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  30.38 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 466 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  31.52 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  41.18 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  39.06 
 
 		 108 aa  42.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  36.84 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2440  phage shock protein C, PspC  42.59 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.4 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  21.7 
 
 		 244 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 		 68 aa  42  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  35.09 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 		 578 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  38.78 
 
 		 240 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0421  phage shock protein C, PspC  34.33 
 
 		 82 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  30.91 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 417 aa  40.8  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  36.54 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  39.68 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2824  phage shock protein C, PspC  38.81 
 
 		 207 aa  40.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  33.9 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  36.54 
 
 		 416 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  32.86 
 
 		 306 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  34.48 
 
 		 515 aa  40  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>