113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0611 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0611  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 237 aa  484  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03346  hypothetical protein  43.36 
 
 		 232 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06190  hypothetical protein  37.39 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0375  putative secretion system protein  31.14 
 
 		 247 aa  95.1  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0542373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0679  putative lipoprotein  28.69 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.185278  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0263  hypothetical protein  27.85 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000241482  hitchhiker  0.0000287047 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0596  putative lipoprotein  28.27 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 750 aa  57.4  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  21.89 
 
 		 1069 aa  56.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.72 
 
 		 883 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.97 
 
 		 375 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 		 315 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.3 
 
 		 820 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0206  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 345 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.56 
 
 		 689 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1421 aa  52  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  24.4 
 
 		 503 aa  52  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 2262 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 349 aa  51.2  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 780 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.64 
 
 		 818 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 3145 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  27.22 
 
 		 729 aa  48.9  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25 
 
 		 733 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 2262 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  22 
 
 		 681 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 543 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 448 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0047  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 506 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0614925  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.18 
 
 		 988 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.16 
 
 		 810 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  24.6 
 
 		 272 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 		 1486 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0811  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 139 aa  46.6  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 326 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 744 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.1 
 
 		 884 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  28.45 
 
 		 1056 aa  46.2  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 374 aa  46.6  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.49 
 
 		 725 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 827 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.71 
 
 		 632 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.68 
 
 		 784 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.14 
 
 		 1056 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1987  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 891 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2211  TPR domain protein  29.57 
 
 		 891 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06184e-33 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 566 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  23.35 
 
 		 587 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  23.35 
 
 		 545 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2038  TPR domain-containing protein  29.57 
 
 		 426 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 927 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2193  TPR domain-containing protein  29.57 
 
 		 426 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  23.04 
 
 		 643 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 649 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 		 1061 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 465 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 391 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0033  protein-glutamate O-methyltransferase  22.84 
 
 		 490 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 4079 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 520 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.88 
 
 		 836 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.27 
 
 		 1022 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  22.4 
 
 		 586 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 425 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 465 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  24.24 
 
 		 648 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 878 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 468 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  31.13 
 
 		 1262 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2572  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 288 aa  43.5  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  24.4 
 
 		 1073 aa  43.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2027  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 891 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 		 784 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.44 
 
 		 624 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  23.53 
 
 		 340 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  24.82 
 
 		 875 aa  43.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  25.31 
 
 		 440 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0990  tetratricopeptide TPR_2  28.38 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  27.97 
 
 		 955 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 629 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 		 544 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.87 
 
 		 1056 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  25.33 
 
 		 767 aa  43.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  31.51 
 
 		 135 aa  42.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 565 aa  42.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  23.23 
 
 		 837 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.63 
 
 		 409 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4209  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  25.45 
 
 		 502 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135133  normal  0.0700485 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.43 
 
 		 557 aa  42.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0901  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.85 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.33 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.05 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  27.27 
 
 		 321 aa  42.4  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 700 aa  42.4  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  40 
 
 		 769 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  30.28 
 
 		 581 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 1406 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  24.34 
 
 		 456 aa  42.4  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  29.79 
 
 		 745 aa  42.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>