38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06190 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06190  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  490  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03346  hypothetical protein  44.59 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0611  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0375  putative secretion system protein  30.4 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0542373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0679  putative lipoprotein  25.31 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.185278  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0596  putative lipoprotein  25.31 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0263  hypothetical protein  24.9 
 
 		 256 aa  62  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000241482  hitchhiker  0.0000287047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.13 
 
 		 884 aa  55.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1520  Tetratricopeptide repeat protein  26.58 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 934 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1008  TPR repeat-containing protein  21.28 
 
 		 359 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000389173  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07986  hypothetical protein  27.04 
 
 		 388 aa  46.6  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249139  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 567 aa  45.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.08 
 
 		 352 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 750 aa  45.8  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.71 
 
 		 818 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.3 
 
 		 850 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 942 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  23.68 
 
 		 929 aa  43.5  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 1056 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  20.86 
 
 		 748 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 632 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 605 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  21.21 
 
 		 883 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.42 
 
 		 733 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.67 
 
 		 758 aa  42.7  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  24.02 
 
 		 503 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  20.83 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 416 aa  42.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.65 
 
 		 263 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.41 
 
 		 988 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.7 
 
 		 186 aa  42  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 274 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 1230 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0684  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 626 aa  42  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 566 aa  41.6  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>