138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0495 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  100 
 
 		 411 aa  862    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  61.59 
 
 		 418 aa  533  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  42.38 
 
 		 429 aa  335  7e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  39.72 
 
 		 449 aa  325  7e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  40.14 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  33.15 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  33.81 
 
 		 418 aa  170  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  33.05 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  33.05 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  32.09 
 
 		 431 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  34.28 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  33.92 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  29.95 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  31.79 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  28.95 
 
 		 432 aa  143  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  28.81 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  27.82 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  30 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  30.75 
 
 		 419 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  29.06 
 
 		 433 aa  123  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  29.6 
 
 		 392 aa  123  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  27.42 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  34.38 
 
 		 295 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  26.81 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  29.17 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  27.55 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  28.57 
 
 		 433 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  27.27 
 
 		 426 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  28.81 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  28.89 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  28.09 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  28.43 
 
 		 434 aa  94.4  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  27.72 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  27.18 
 
 		 415 aa  93.2  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  28.87 
 
 		 409 aa  90.1  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  28.18 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  26.54 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  28.7 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  26.1 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  26.73 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  26.23 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  27.65 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  27.3 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  30.04 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  27.38 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  26.87 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  27.57 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  28.35 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  27.34 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  28.65 
 
 		 420 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  26.98 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  27.87 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  27.12 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  26.07 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  26.92 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  27.33 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  27.04 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  23.98 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  36.21 
 
 		 120 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  26.3 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  25.68 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  25.81 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  25.84 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  25.84 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  28.05 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  24.92 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  27.72 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  27.3 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  25.19 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  27.09 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  25.6 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  24.93 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  22.73 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  24.23 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  26.75 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  24.48 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  24.44 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  24.48 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  24.59 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  24.86 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  27.46 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  24.33 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  24.33 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  25.6 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  23.56 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  24.23 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  26.2 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  25.35 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  25.25 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  27.98 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  26 
 
 		 433 aa  57  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  23.37 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  22.25 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  25.55 
 
 		 480 aa  56.2  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  25.16 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  25.23 
 
 		 460 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  24.48 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  24.23 
 
 		 435 aa  53.9  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  26.4 
 
 		 447 aa  53.1  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  25.7 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>