80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1364 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  311  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  41.06 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0593  transcription activator, effector binding  46.1 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  41.01 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4131  transcriptional activator ligand binding domain protein  41.18 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  37.41 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  35 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  30.92 
 
 		 274 aa  92  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  29.71 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  31.58 
 
 		 274 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  39.08 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  29.86 
 
 		 321 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1132  transcription activator, effector binding  26.57 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  28.57 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  28.1 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  28.47 
 
 		 550 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  33.33 
 
 		 286 aa  64.7  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4607  transcription activator, effector binding  31.5 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0684789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  27.66 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4913  transcriptional activator ligand binding domain protein  26 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00232908  normal  0.22679 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 277 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 277 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1237  transcription activator, effector binding  26.17 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  26.71 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  24.64 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  28.91 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  33.71 
 
 		 276 aa  53.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22660  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  31.65 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3920  transcription activator, effector binding  22.83 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0296  transcription activator effector binding  38.33 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.285639 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 265 aa  50.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 270 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20280  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  28.05 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0307549  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0371  hypothetical protein  23.08 
 
 		 240 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1851  transcription activator effector binding  27.03 
 
 		 241 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.493771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  31.34 
 
 		 279 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 287 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  31.58 
 
 		 273 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 279 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  23.01 
 
 		 286 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 288 aa  47  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0250  transcription activator effector binding  22.97 
 
 		 260 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0263  transcription activator, effector binding protein  25.16 
 
 		 166 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  40.32 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2777  transcription activator, effector binding  23.19 
 
 		 242 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0772774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 		 269 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 289 aa  45.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  26.17 
 
 		 273 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2214  transcriptional activator ligand binding domain protein  22.7 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307481  normal  0.371698 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 273 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 		 269 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  36.78 
 
 		 288 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  30 
 
 		 270 aa  44.7  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2209  transcription activator, effector binding  29.27 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1653  transcriptional activator ligand binding domain protein  20.5 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0385055  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 280 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  22.81 
 
 		 280 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2480  transcription activator, effector binding  35.44 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0216  transcription activator, effector binding  22.4 
 
 		 252 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  hitchhiker  0.00731322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2946  transcription activator effector binding  25.69 
 
 		 298 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  hitchhiker  0.00143394 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0513  transcription activator, effector binding  21.01 
 
 		 268 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5334  transcription activator effector binding  25.52 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  25.47 
 
 		 271 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3263  transcription activator effector binding  26.36 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05573  hypothetical protein  27.27 
 
 		 309 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0182  transcription activator effector binding  23.64 
 
 		 236 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  21.99 
 
 		 243 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6627  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.31 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787104  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3657  transcription activator effector binding  25.45 
 
 		 259 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  hitchhiker  0.00540131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  34.33 
 
 		 209 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0005  hypothetical protein  22.22 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.251807  normal  0.30014 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  29.06 
 
 		 257 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  35.63 
 
 		 288 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  35.63 
 
 		 288 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  35.63 
 
 		 288 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 283 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2841  transcription activator effector binding  25.6 
 
 		 249 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.203894 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  38.1 
 
 		 308 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  42.86 
 
 		 199 aa  40.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>